99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4310 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  272  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  93.38 
 
 		 136 aa  239  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  87.5 
 
 		 136 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  67.97 
 
 		 127 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  70.63 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  65.08 
 
 		 127 aa  156  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  64.29 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  47.2 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  45.37 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  45.37 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  44.35 
 
 		 125 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  43.48 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  44.17 
 
 		 123 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  44.17 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  41.74 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  47.83 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  46.55 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  41.74 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  84.3  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  37.93 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  39.81 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  36.52 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  43.52 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  50.75 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  42.59 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  41.03 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  33.93 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  39.66 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  37.14 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  35.71 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  31.58 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  34.29 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  34.29 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  27.42 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  29.35 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  32.05 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  32.05 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  44.44 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  33.04 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  31.17 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  34.12 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  23.93 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  31.43 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  30.67 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  30.67 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  30.67 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  30.67 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  30.67 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  27.88 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  31.43 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  32.58 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  34.29 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  29.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  29.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  33.8 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  29.51 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  34.78 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  26.5 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  31.25 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  34.78 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  29.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  29.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  30.21 
 
 		 104 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  36.51 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  35.38 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.984817 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  37.5 
 
 		 109 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>