35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1736 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  100 
 
 
134 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  68.1 
 
 
181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  59.54 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  59.54 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  65.38 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  58.02 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1881  hypothetical protein  46.3 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  33.86 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  33.86 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  36.14 
 
 
108 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  35.88 
 
 
112 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  34.38 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  27.27 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  29.01 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  33.75 
 
 
123 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  31.25 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  31.58 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  33.75 
 
 
124 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  32.56 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  25 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  32.63 
 
 
136 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  31.96 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  29.09 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  32.98 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  27.2 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  27.2 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  31.43 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  33.75 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  28.57 
 
 
121 aa  47  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  32.91 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  32.53 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  32.53 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  36 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  31.25 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  29.21 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>