43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1724 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  91.51 
 
 		 107 aa  200  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  72.65 
 
 		 119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  61.34 
 
 		 125 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  60 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  60.5 
 
 		 125 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  78.57 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  47.5 
 
 		 127 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  45.69 
 
 		 127 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  52.04 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  48.15 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  44.92 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  47.22 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  45.37 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  47.22 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  45.05 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  40.71 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  42.48 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  43.59 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  53.25 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  53.25 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  44.92 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  44.14 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  37.07 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  47.5 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  35.34 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  32.89 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  46.58 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  24.14 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  25.45 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  34.38 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  31.87 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  34.38 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  27.2 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  28.24 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  31.82 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  25.86 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  26.56 
 
 		 99 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  32.1 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  27.71 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  26.97 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>