45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2110 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  230  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  34.75 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  33.9 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  36.21 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  38.79 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  37.07 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  37.07 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  37.07 
 
 		 119 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  37.29 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  41.3 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  50.77 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  37.93 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  42.7 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  40.91 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  37.76 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  40.91 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  38.89 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  40.91 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  39.17 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  44.62 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  36.27 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  42.05 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  25.86 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  33.86 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  38.66 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  37.72 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  36.84 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  31.09 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  34 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  39.66 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  27.78 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  34.69 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  31.62 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  36.07 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  37.5 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  37.5 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  36.11 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  27.94 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  29.41 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  32.48 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0720  hypothetical protein  28.71 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>