37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1492 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  100 
 
 
113 aa  221  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  66.18 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  67  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  34.51 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  36.36 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  38.81 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  34.21 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  44.44 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  43.75 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  44.44 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  31.36 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  40 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  41.27 
 
 
127 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  38.46 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  34.33 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  39.39 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  38.46 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  38.1 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  41.54 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  31.82 
 
 
123 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  38.1 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  39.06 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  31.82 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  33.04 
 
 
117 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  31.82 
 
 
121 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  41.54 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  41.54 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  37.14 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  36.62 
 
 
117 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  42.42 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  29.03 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  39.68 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  34.86 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>