47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3234 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  96 
 
 
125 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  68.8 
 
 
125 aa  184  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  63.56 
 
 
119 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  61.34 
 
 
121 aa  151  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  61.34 
 
 
121 aa  151  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  60 
 
 
121 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  56.19 
 
 
107 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  42.62 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  47.41 
 
 
127 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  43.44 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  44.35 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  42.74 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  44.83 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  50.59 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  44.35 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  45.22 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  43.48 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  40.83 
 
 
123 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  40.83 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  40.83 
 
 
123 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  34.75 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  40.65 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  37.29 
 
 
124 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  44.63 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  33.94 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  32.43 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  37.07 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  32.53 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  32.53 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  38.81 
 
 
113 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  25 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  31.87 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  31.76 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  26.79 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  24.56 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  30.86 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  43.75 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  23.64 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1881  hypothetical protein  35.63 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1338  protein of unknown function DUF710  32.89 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.72 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  30.77 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  21.65 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>