88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0162 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  237  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  60.34 
 
 
123 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  57.76 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  57.76 
 
 
123 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  61.47 
 
 
127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  50.82 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  49.17 
 
 
124 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  41.94 
 
 
125 aa  100  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  62.39 
 
 
123 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  52.04 
 
 
121 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  52.04 
 
 
121 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  50.41 
 
 
146 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  45.97 
 
 
125 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  50.57 
 
 
119 aa  93.6  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  44.35 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  52.17 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  54.29 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  54.02 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  55.7 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  53.09 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  55.7 
 
 
136 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  55.7 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  52.22 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  40.35 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  46.59 
 
 
107 aa  76.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  37.76 
 
 
119 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  35.8 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  37.65 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  37.65 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  38.64 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  40.96 
 
 
117 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  34.18 
 
 
181 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  33.75 
 
 
134 aa  53.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  33.62 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  39.13 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  34.38 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  39.13 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  38.36 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  39.71 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  38.36 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  31.96 
 
 
102 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  37.8 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  38.24 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  37.88 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  38.46 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  39.39 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  35.44 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  34.04 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  38.81 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  34.33 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  35.48 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1749  hypothetical protein  33.82 
 
 
91 aa  43.9  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0526906  normal  0.375639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  37.31 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  29.07 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  27.66 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  37.31 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  26.8 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  35.82 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  37.5 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  29.69 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  31.4 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  30.99 
 
 
121 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  38.33 
 
 
105 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1881  hypothetical protein  31.82 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  36.67 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  38.33 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  38.33 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  36.92 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  27.84 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>