85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7288 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  100 
 
 
123 aa  230  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  93.33 
 
 
127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  58.47 
 
 
127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  62.39 
 
 
123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  57.5 
 
 
123 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  54.47 
 
 
123 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  54.47 
 
 
123 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  51.28 
 
 
124 aa  107  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  44.92 
 
 
121 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  44.92 
 
 
121 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  46.15 
 
 
119 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  42.5 
 
 
125 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  44.63 
 
 
125 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  43.97 
 
 
125 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  48.7 
 
 
127 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  45.69 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  47.41 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  55.71 
 
 
121 aa  90.1  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  47.27 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  42.31 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  38.18 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  39.66 
 
 
119 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  35.34 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  48.75 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  48.24 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  48.75 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  37.19 
 
 
117 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  26.5 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  34.48 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  35.45 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  37.97 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  36.71 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  37.97 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  24.79 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  31.71 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  34.72 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  34.72 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  42.03 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  42.03 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  29.2 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  36.71 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  42.03 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  42.03 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  42.03 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  42.03 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  26.44 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  30.83 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  27.27 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  37.88 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  29.87 
 
 
108 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  36 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  38.24 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  32.89 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  34.07 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  22.92 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  34.62 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  34.78 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  40.58 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  38.33 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  32.86 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  33 
 
 
98 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  24.14 
 
 
102 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  40.58 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  28.79 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  24.66 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  38.33 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  38.33 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  38.33 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  31.34 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  30.34 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  31.34 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  24.66 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>