39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2600 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  38.18 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  35.34 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  31.9 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  38.1 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  36.44 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  34.21 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  47.06 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  38.1 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  41.79 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  37.18 
 
 		 108 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  33.33 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  36.99 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  34.55 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  32.48 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  29.31 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  39.34 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  27.73 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  41.54 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  40.32 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  35.62 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  36.92 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  31.34 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  33.33 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  30.09 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  33.8 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  36.92 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  25.86 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  25.86 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  31.34 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  22.32 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  31.82 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  30.71 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  35.34 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  42.42 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  35.38 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>