64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2732 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  250  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  87.4 
 
 
127 aa  199  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  72.44 
 
 
127 aa  169  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  70.63 
 
 
127 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  67.46 
 
 
136 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  65.08 
 
 
136 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  63.49 
 
 
136 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  41.8 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  42.62 
 
 
123 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  42.74 
 
 
125 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  45.45 
 
 
119 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  44.44 
 
 
123 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  41.88 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  44.14 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  44.14 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  50 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  47.46 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  39.32 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  45.69 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  40.91 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  36.44 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  39.32 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  42.27 
 
 
107 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  47.14 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  45.69 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  40.91 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  32.46 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  36.21 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  30.93 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  32.35 
 
 
99 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  30.21 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  40 
 
 
113 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  28.81 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  36.92 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  32.1 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  30.88 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  31.88 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  31.88 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  32.89 
 
 
97 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  32.35 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  26.51 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  26.98 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  32.35 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  32.35 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  31.88 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  31.82 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  32.35 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  32.35 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  31.11 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  25.89 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>