96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2641 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  100 
 
 
123 aa  243  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  99.19 
 
 
123 aa  241  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  91.06 
 
 
123 aa  220  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  52.8 
 
 
127 aa  120  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  57.76 
 
 
123 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  46.4 
 
 
127 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  56.07 
 
 
146 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  53.66 
 
 
123 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  47.15 
 
 
127 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  41.8 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  57.33 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  58.11 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  44.26 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  43.33 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  56 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  42.86 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  43.22 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  54.67 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  40.83 
 
 
125 aa  87  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  53.25 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  53.25 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  44.07 
 
 
119 aa  84.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  54.05 
 
 
125 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  36.7 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  36.51 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  51.67 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  37.72 
 
 
119 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  29.91 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  36.21 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  35.79 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  35.79 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  41.67 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  35.96 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  37.31 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  34.67 
 
 
97 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  28.95 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  39.19 
 
 
148 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  33.02 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  32.89 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  35.29 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  26.09 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  38.36 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  39.71 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  31.18 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  31.71 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  34.85 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  26.98 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  30.14 
 
 
102 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  32.53 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  24.64 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  36.07 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  27.54 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  36.07 
 
 
106 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  38.1 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  36.07 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  36.07 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  36.07 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  34.33 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  25.76 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  37.1 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  33.85 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  28.79 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  37.1 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  26.09 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  30.91 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  36.51 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  26.09 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  35 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  35.48 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  30 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  36.51 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  25.76 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  25.76 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  25 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  25 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  25 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  25 
 
 
100 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  37.1 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  24.24 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0684  cell division protein ZapA  26.25 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000536576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  34.92 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  30.3 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  35.48 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  35.48 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  35.48 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  35.48 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  35.48 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  35.21 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  34.33 
 
 
101 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>