103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3073 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  246  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  47.5 
 
 
121 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  47.5 
 
 
121 aa  118  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  55.08 
 
 
127 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  48.03 
 
 
127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  47.24 
 
 
127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  47.01 
 
 
119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  48.41 
 
 
127 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  47.24 
 
 
127 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  50.82 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  47.41 
 
 
125 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  47.97 
 
 
123 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  47.41 
 
 
125 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  46.4 
 
 
123 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  47.2 
 
 
136 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  46.4 
 
 
123 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  48.11 
 
 
107 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  46.4 
 
 
136 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  51.64 
 
 
146 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  45.08 
 
 
124 aa  103  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  46.4 
 
 
136 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  42.24 
 
 
125 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  58.47 
 
 
123 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  38.79 
 
 
127 aa  87.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  42.86 
 
 
121 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  38.79 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  32.76 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  41.74 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  29.91 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  31.9 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  31.9 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  29.01 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  32.53 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  32.53 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  27.59 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  35.79 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  30.12 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  30.3 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  26.44 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  27.43 
 
 
108 aa  47  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  27.59 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  27.59 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  30.3 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  27.59 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  27.59 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  29.87 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  27.59 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  28.97 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  30.3 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  35 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  26.44 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  35.48 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.24 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  26.44 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  26.44 
 
 
100 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  21.93 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  30.3 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  35.82 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  27.06 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  31.58 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  35.38 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  37.31 
 
 
113 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  34.21 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  38.1 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  31.82 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  35 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  30.59 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  30.99 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  32.81 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  33.33 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  33.7 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  30.67 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  34.43 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  21.05 
 
 
121 aa  41.6  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  27.83 
 
 
104 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2048  hypothetical protein  27.68 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  34.43 
 
 
104 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  31.67 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  25.88 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  31.67 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  31.67 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  31.67 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  28.74 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  31.67 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  31.67 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  28.24 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>