61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3642 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  60 
 
 		 125 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  62.07 
 
 		 125 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  57.6 
 
 		 125 aa  136  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  60.87 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  75.68 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  75.68 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  48.62 
 
 		 127 aa  110  7.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  67.21 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  42.4 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  44.54 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  42.11 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  52.56 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  42.86 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  42.86 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  40.94 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  52.05 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  48.65 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  52.17 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  46.67 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  51.47 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  52.17 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  44 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  48.65 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  47.3 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  41.03 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  53.85 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  44.62 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  35.59 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  36.36 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  32.94 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  32.94 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  51.2  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  30.67 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  45.83 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  33.8 
 
 		 108 aa  47.4  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  32.81 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  32.31 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  28.32 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  30.59 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1338  protein of unknown function DUF710  27.83 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  32.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  32.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  32.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  32.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  32.1 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  25.86 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  30.86 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  29.03 
 
 		 106 aa  40  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  28.79 
 
 		 99 aa  40  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>