45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2492 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  209  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  66.18 
 
 
113 aa  88.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  50.75 
 
 
108 aa  70.5  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  36.19 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  33.93 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  38.83 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  36.13 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  49.23 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  40.3 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  35.04 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  34.95 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  40 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  37.8 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  34.95 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  43.24 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  42.86 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  40 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  43.55 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  31.9 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  43.55 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  37.88 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  38.81 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  38.1 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  37.88 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  38.46 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  30.43 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  30.43 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  38.89 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  27.85 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  39.05 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  40.57 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  37.04 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2128  hypothetical protein  40.28 
 
 
95 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  36.92 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  29.91 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  35.53 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  28.71 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  35.53 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  37.31 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002482  Z-ring-associated protein ZapA  30.3 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03552  hypothetical protein  29.29 
 
 
102 aa  41.2  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  41.89 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  36.51 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  27.12 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>