32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1702 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  278  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  49.65 
 
 
134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  56.6 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  58.97 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  58.97 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  57.69 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1881  hypothetical protein  52.56 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  32.64 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  30.82 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  34 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  34.62 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  31.65 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  34.38 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  26.58 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  28.87 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  28.69 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  28.97 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  31.52 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  34.07 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  33.33 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  27.42 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  40.32 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  30.3 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  35.48 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  35.48 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  30.67 
 
 
136 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  29.85 
 
 
121 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  37.31 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  27.71 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  27.71 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  29.27 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  28.24 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>