47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3530 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  96 
 
 		 125 aa  241  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  67.2 
 
 		 125 aa  177  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  64.41 
 
 		 119 aa  158  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  60 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  60 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  61.21 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  55.14 
 
 		 107 aa  121  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  42.62 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  47.41 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  45.97 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  57.89 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  43.97 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  41.88 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  44.35 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  44.35 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  38.21 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  45.22 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  49.41 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  33.9 
 
 		 119 aa  84.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  40.65 
 
 		 146 aa  84.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  54.05 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  54.05 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  54.05 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  48.75 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  55 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  33.94 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  72.8  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  37.07 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  31.63 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  31.63 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  27.27 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  33.77 
 
 		 181 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  34.21 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  31.76 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  32.1 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  24.56 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  24.55 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1881  hypothetical protein  36.78 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  30.3 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1338  protein of unknown function DUF710  33.77 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  31.73 
 
 		 105 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.72 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  38.33 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  27.59 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  21.65 
 
 		 99 aa  40  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>