52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2648 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  256  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  68.8 
 
 		 125 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  67.2 
 
 		 125 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  63.56 
 
 		 119 aa  153  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  60.5 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  60.5 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  84.29 
 
 		 121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  56.19 
 
 		 107 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  42.62 
 
 		 127 aa  101  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  41.94 
 
 		 123 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  44.35 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  42.24 
 
 		 127 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  42.15 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  43.33 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  45.74 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  42.5 
 
 		 123 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  38.98 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  50 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  50 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  43.1 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  47.67 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  48.75 
 
 		 127 aa  83.6  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  36.21 
 
 		 119 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  39.32 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  34.15 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  55 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  35.79 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  38.79 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  34.41 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  29.63 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  29.63 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  31.25 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  34.33 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  25.45 
 
 		 121 aa  47.8  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  28.4 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  24.55 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  28.69 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  27.66 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  29.87 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  30.26 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  27.08 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  28.95 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  28.95 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  31.82 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  28.95 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  28.95 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  28.95 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  26.56 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  28.95 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  30.65 
 
 		 106 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>