87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2320 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  100 
 
 
123 aa  244  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  91.06 
 
 
123 aa  220  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  90.24 
 
 
123 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  60.34 
 
 
123 aa  120  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  53.33 
 
 
127 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  47.97 
 
 
127 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7288  protein of unknown function DUF710  55 
 
 
123 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.38176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  48.06 
 
 
146 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  47.01 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  45.9 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2648  hypothetical protein  42.15 
 
 
125 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.404391  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3642  hypothetical protein  42.11 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  58.11 
 
 
127 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  44.92 
 
 
119 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  41.88 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  56.16 
 
 
136 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1667  hypothetical protein  42.48 
 
 
121 aa  87  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.234944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1724  hypothetical protein  42.48 
 
 
121 aa  87  7e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  54.79 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  40.83 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3530  protein of unknown function DUF710  54.05 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0917353  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  53.42 
 
 
136 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  42.48 
 
 
127 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  37.61 
 
 
127 aa  79  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  46.59 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1192  hypothetical protein  42.42 
 
 
107 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0254458  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  30.84 
 
 
108 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  36.21 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  36.84 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  38.3 
 
 
124 aa  57  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  38.3 
 
 
124 aa  57  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  46.58 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  38.36 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  39.19 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0891  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.134643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  35.82 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  28.79 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  31.82 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  39.13 
 
 
97 aa  47  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1492  protein of unknown function DUF710  38.46 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  33.75 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  32.93 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1702  hypothetical protein  35.79 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00638023  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  25.76 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0621  hypothetical protein  32.35 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  26.98 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1088  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.230381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  32.08 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  36.99 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0398  hypothetical protein  31.43 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  25.76 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  28.79 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  25.76 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  33.02 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  24.24 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  23.61 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  35.38 
 
 
100 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  36.07 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  35 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  35 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  25.76 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  35 
 
 
106 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  36.07 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  35 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  36.67 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  30.19 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  32.31 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2128  hypothetical protein  35.71 
 
 
95 aa  40.8  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  32.84 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  36.07 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  32.5 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  33.96 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  25.76 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  25.76 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  25.76 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  22.73 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  25.76 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  29.25 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  29.25 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  29.25 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  29.25 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2492  hypothetical protein  37.5 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.843914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  25.76 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  29.25 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  29.25 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>