27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1321 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1321  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  283  5e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168543  normal  0.246883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1970  hypothetical protein  43.53 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00126739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2444  hypothetical protein  31.5 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0162  hypothetical protein  38.64 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0769  hypothetical protein  38.81 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385669  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2110  hypothetical protein  34.69 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.431679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  35.9 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  39.19 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  32.43 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1115  hypothetical protein  35.48 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2364  hypothetical protein  39.19 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.398462  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2600  hypothetical protein  34.44 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.696113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2641  protein of unknown function DUF710  39.19 
 
 		 123 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  normal  0.374723 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3234  protein of unknown function DUF710  26.45 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  34.11 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  32.05 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  39.19 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  28.4 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4764  hypothetical protein  33.73 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  40.98 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  40.98 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1736  putative cell division protein ZapA  34.02 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174413  normal  0.490068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  31.25 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1083  hypothetical protein  32.86 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.439325  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2732  hypothetical protein  30.86 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>