87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3044 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  100 
 
 
109 aa  220  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3219  Z-ring-associated protein  96.33 
 
 
109 aa  212  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000367602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3293  Z-ring-associated protein  96.33 
 
 
109 aa  212  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000277153  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3296  Z-ring-associated protein  96.33 
 
 
109 aa  212  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000920152  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3329  Z-ring-associated protein  88.99 
 
 
109 aa  199  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000688409  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  86.24 
 
 
109 aa  192  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  86.24 
 
 
109 aa  192  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  85.32 
 
 
109 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  83.49 
 
 
109 aa  189  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  82.57 
 
 
109 aa  185  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0861  Z-ring-associated protein  79.82 
 
 
109 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0858  Z-ring-associated protein  79.82 
 
 
109 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.48615e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3825  Z-ring-associated protein  79.82 
 
 
109 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000023514  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3398  hypothetical protein  92.98 
 
 
57 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000485906  normal  0.526594 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3231  hypothetical protein  92.98 
 
 
57 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000246663  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  46.81 
 
 
113 aa  97.8  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  42.71 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  44.33 
 
 
100 aa  86.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  41.67 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  39.8 
 
 
102 aa  84.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  43.75 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  43.75 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  42.42 
 
 
102 aa  84.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  45.74 
 
 
102 aa  84  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03552  hypothetical protein  43.62 
 
 
102 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  43.75 
 
 
102 aa  83.6  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  42.42 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  43.75 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002482  Z-ring-associated protein ZapA  42.55 
 
 
102 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  43.75 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  43.75 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  43.75 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  39.8 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  42.71 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  42.71 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0684  cell division protein ZapA  40.45 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000536576  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  34.78 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  30.3 
 
 
104 aa  67  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  35.05 
 
 
103 aa  67  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  33.71 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  31.18 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  33.71 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  37.66 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  29.07 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  42.42 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  28.71 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  32.18 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  27.17 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2580  hypothetical protein  28.89 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0497973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  28.74 
 
 
104 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  28.74 
 
 
104 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1268  hypothetical protein  35.11 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  32.89 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  32.43 
 
 
100 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  25 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  28.71 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  31.34 
 
 
97 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  29.67 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  28.72 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  27.37 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  27.37 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  26.32 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  30.61 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  28.09 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  26.32 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  32.81 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  27.47 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  27.47 
 
 
99 aa  43.5  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  31.25 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4464  hypothetical protein  32.26 
 
 
136 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  26.47 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  29.03 
 
 
108 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  23.81 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  31.15 
 
 
147 aa  40.8  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4310  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.850592 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0077  hypothetical protein  24.1 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0089  hypothetical protein  24.1 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  23.81 
 
 
104 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  26.56 
 
 
109 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>