122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5110 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  99.06 
 
 		 106 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  99.06 
 
 		 106 aa  215  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  94.34 
 
 		 106 aa  204  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  80.19 
 
 		 105 aa  168  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  79.21 
 
 		 109 aa  157  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  79.21 
 
 		 109 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  74 
 
 		 101 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  72.55 
 
 		 104 aa  145  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  73.53 
 
 		 104 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  72.82 
 
 		 104 aa  143  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  49.48 
 
 		 100 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  52.58 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  51.61 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  46.94 
 
 		 97 aa  87.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  60 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  51.39 
 
 		 97 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  56.72 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  41.41 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  46.67 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  49.33 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  40.95 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  50.75 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  51.52 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  51.52 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  37.76 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  43.75 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  33.94 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  33.94 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  38.38 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  40.79 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  33.94 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  33.94 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  33.66 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  35.19 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  40.32 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  39.39 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  32.88 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  32.88 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  39.71 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  38.57 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  41.18 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  39.71 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  39.71 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3329  Z-ring-associated protein  27.72 
 
 		 109 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000688409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  39.71 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2788  cell division protein ZapA  32.71 
 
 		 115 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  31.63 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3293  Z-ring-associated protein  27.84 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000277153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3219  Z-ring-associated protein  27.84 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000367602  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3296  Z-ring-associated protein  27.84 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000920152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  31.63 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  28.12 
 
 		 109 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  32.88 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  28.12 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  27.37 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  26.32 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  37.88 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  26.32 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  31.51 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0858  Z-ring-associated protein  27.27 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.48615e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  28.12 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3825  Z-ring-associated protein  27.27 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000023514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0861  Z-ring-associated protein  27.27 
 
 		 109 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.77 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  37.7 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  28.99 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002482  Z-ring-associated protein ZapA  30 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  28.99 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  31.43 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  28.99 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03552  hypothetical protein  29 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  28.99 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  30.56 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  30.56 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  30.56 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  30.56 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0720  hypothetical protein  39.39 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>