123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3335 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  100 
 
 
100 aa  203  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  100 
 
 
100 aa  203  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  98 
 
 
100 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  96 
 
 
100 aa  197  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  94 
 
 
100 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  92 
 
 
100 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  92 
 
 
100 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  92 
 
 
100 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  92 
 
 
100 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  83.67 
 
 
99 aa  168  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  77 
 
 
102 aa  161  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  76 
 
 
102 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  73 
 
 
102 aa  150  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  72 
 
 
106 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  74 
 
 
102 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  70 
 
 
102 aa  146  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  42.71 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0858  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.48615e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3825  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000023514  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0861  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455122  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  40.82 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  39.8 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3219  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000367602  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3296  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000920152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3293  Z-ring-associated protein  41.67 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000277153  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3329  Z-ring-associated protein  40.62 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000688409  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  38.46 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  38.46 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  37.23 
 
 
102 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  41.49 
 
 
105 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  28.41 
 
 
99 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002482  Z-ring-associated protein ZapA  31.91 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  32.98 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03552  hypothetical protein  31.91 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0684  cell division protein ZapA  32.98 
 
 
99 aa  59.3  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000536576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  33.7 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  31.25 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  31.63 
 
 
99 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  32.61 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  34.04 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0089  hypothetical protein  34.44 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  36.92 
 
 
97 aa  53.5  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0077  hypothetical protein  34.44 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1268  hypothetical protein  37.23 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  29.41 
 
 
98 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  30.53 
 
 
100 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  35.82 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  25.26 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  32.26 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  35 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  35 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  36.92 
 
 
105 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  35.59 
 
 
111 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  27.91 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  35.38 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3398  hypothetical protein  45.65 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000485906  normal  0.526594 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0135  hypothetical protein  32.56 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3231  hypothetical protein  45.65 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000246663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1017  protein of unknown function DUF710  29.03 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  30.56 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  31.87 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  24.73 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  31.67 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  28.99 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  30.56 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3073  hypothetical protein  26.44 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19332  normal  0.461059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  30 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  30.56 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3529  hypothetical protein  33.82 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.632634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  23.91 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6921  cell division protein ZapA  32.35 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  21.98 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  34.38 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  32.31 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  28.99 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  30.56 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  26.6 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3442  hypothetical protein  26.67 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  26.6 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  26.6 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  26.6 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  26.6 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  26.6 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  25.27 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  27.12 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  32.31 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2320  protein of unknown function DUF710  25.76 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>