More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3732 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
233 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  96.14 
 
 
233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  92.27 
 
 
233 aa  441  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  82.4 
 
 
233 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64.47 
 
 
236 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.61 
 
 
233 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.79 
 
 
251 aa  291  7e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.78 
 
 
233 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64 
 
 
243 aa  286  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  57.94 
 
 
234 aa  272  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64 
 
 
244 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.56 
 
 
243 aa  269  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.6 
 
 
233 aa  262  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.21 
 
 
229 aa  211  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.22 
 
 
227 aa  207  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.86 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.64 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  47.64 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.02 
 
 
232 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.29 
 
 
237 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.44 
 
 
229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.05 
 
 
237 aa  126  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.44 
 
 
233 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.04 
 
 
233 aa  121  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.65 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.67 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.14 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.64 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.78 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.17 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.13 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.13 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.45 
 
 
228 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.53 
 
 
253 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  30.94 
 
 
228 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.27 
 
 
226 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.17 
 
 
233 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.73 
 
 
233 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  30 
 
 
235 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.19 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.52 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.29 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  30.13 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.63 
 
 
237 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.28 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.59 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.64 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.89 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  41.11 
 
 
318 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  46.34 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  32.2 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  39.58 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.5 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  44.58 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.37 
 
 
246 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  28.12 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  34.41 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
252 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.57 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  36.8 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
264 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  33.98 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  50.91 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  44.71 
 
 
260 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  49.21 
 
 
223 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.5 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.21 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  43.21 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  37.5 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  36.36 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.59 
 
 
250 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.3 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  41.86 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 
253 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  37.65 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.36 
 
 
265 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.08 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
991 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.26 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  35.23 
 
 
249 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  35.23 
 
 
249 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.64 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  29.09 
 
 
280 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  39.53 
 
 
253 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  35.23 
 
 
249 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  35.23 
 
 
249 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  34.83 
 
 
344 aa  52  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5001  hypothetical protein  32.97 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012258 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  35.23 
 
 
249 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.26 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>