More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3479 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3479  Cof protein  100 
 
 		 270 aa  550  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1887  Cof protein  85.39 
 
 		 270 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0437079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4160  Cof-like hydrolase  75.09 
 
 		 272 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.183104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3675  Cof protein  65.92 
 
 		 270 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6319  putative Cof hydrolase  60.3 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  55.3 
 
 		 267 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3662  Cof-like hydrolase  51.55 
 
 		 267 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.309394  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3772  Cof-like hydrolase  50.78 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.865494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0457  Cof-like hydrolase  47.37 
 
 		 282 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.287116  normal  0.117356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7133  Cof-like hydrolase  50.95 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3464  Cof-like hydrolase  50 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3771  Cof-like hydrolase  48.66 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.540107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  45.42 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1274  Cof-like hydrolase  45.08 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6359  Cof-like hydrolase  49.25 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.164075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3120  Cof-like hydrolase family protein  43.89 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  42.69 
 
 		 292 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2813  Cof protein  40.84 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2987  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  42.21 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2588  Cof protein  40.93 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  31.82 
 
 		 273 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  32.33 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  29.81 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  30.48 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  30.15 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  28.87 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  29.04 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.2 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  28.62 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  28.46 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  32.34 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4533  hypothetical protein  29.64 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  28.52 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.92 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  26.39 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4408  putative conserved hypothetical protein  29.18 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  28.4 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4607  hypothetical protein  29.29 
 
 		 287 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.356417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2182  Cof-like hydrolase  26.44 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  26.81 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  30.71 
 
 		 268 aa  96.3  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.4 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  28.4 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  28.4 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  28.4 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  28.4 
 
 		 273 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.64 
 
 		 276 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  24.72 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  25.2 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.4 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  26.32 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  24.43 
 
 		 264 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.24 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.04 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.4 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  28.94 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  27.27 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  27.27 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.82 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  26.1 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  29.64 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  28.47 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  24.23 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.29 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  27 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  26.95 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  27.44 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  25.95 
 
 		 279 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.37 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  24.81 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  27.61 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  27.07 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  26.6 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  27.3 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  27.3 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  27.84 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  27.84 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  27.84 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.08 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.62 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  24.45 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  28.78 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  23.85 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  29.01 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1811  Cof-like hydrolase  27.76 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  24.82 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  26.71 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  27.53 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>