261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2636 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2636  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.24477  decreased coverage  0.0000373796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2832  hypothetical protein  84.71 
 
 		 242 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180643  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2958  Allophanate hydrolase subunit 1  73.97 
 
 		 242 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2624  hypothetical protein  72.5 
 
 		 249 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1501  hypothetical protein  71.13 
 
 		 244 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0895527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2040  hypothetical protein  69.71 
 
 		 243 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.733064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4132  putative carboxylase  64.56 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1709  Allophanate hydrolase subunit 1  54.39 
 
 		 241 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1814  Allophanate hydrolase subunit 1  53.81 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21016  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1534  allophanate hydrolase subunit 1  52.91 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5815  allophanate hydrolase subunit 1  49.37 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100836  normal  0.0693408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2132  allophanate hydrolase subunit 1  44.02 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.317589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1595  allophanate hydrolase subunit 1  38.33 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3353  allophanate hydrolase subunit 1  41.53 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0478  allophanate hydrolase, subunit 1  42.48 
 
 		 229 aa  175  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1385  Allophanate hydrolase subunit 1  43.42 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.949213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2047  allophanate hydrolase subunit 1  44.07 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.684193  normal  0.286348 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1145  Allophanate hydrolase subunit 1  37.73 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.110827  normal  0.406689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1496  allophanate hydrolase subunit 1  42.06 
 
 		 252 aa  171  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2336  Allophanate hydrolase subunit 1  43.87 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1104  Allophanate hydrolase subunit 1  41.84 
 
 		 244 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0177742  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3450  hypothetical protein  43.22 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3095  allophanate hydrolase subunit 1  42.8 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.686624  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02000  conserved hypothetical protein TIGR00370  38.53 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3395  allophanate hydrolase subunit 1  37.39 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0629739 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3430  allophanate hydrolase subunit 1  44.55 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1270  Allophanate hydrolase subunit 1  36.53 
 
 		 221 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3141  allophanate hydrolase subunit 1  40.77 
 
 		 239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0710  Allophanate hydrolase subunit 1  36.77 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00179377  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0521  Allophanate hydrolase subunit 1  40.08 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1950  Allophanate hydrolase subunit 1  39.15 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000391255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1700  hypothetical protein  33.04 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1666  hypothetical protein  33.04 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.947071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0178  Allophanate hydrolase subunit 1  37.04 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4367  Allophanate hydrolase subunit 1  40.48 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1506  hypothetical protein  39.83 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.227592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2874  allophanate hydrolase subunit 1  33.62 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.480079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2148  hypothetical protein TIGR00370  33.19 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2062  allophanate hydrolase subunit 1  34.23 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.206067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0988  allophanate hydrolase subunit 1  33.63 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0659374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3511  allophanate hydrolase subunit 2  42.86 
 
 		 539 aa  142  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.80956  normal  0.701023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2882  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0696288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3097  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.12026  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3102  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.88 
 
 		 237 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1172  hypothetical protein  30.67 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2849  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3088  conserved hypothetical protein TIGR00370  32.75 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3121  hypothetical protein  31.88 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2803  allophanate hydrolase subunit 1  37.5 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0372  allophanate hydrolase subunit 1  36.64 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal  0.529517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2810  hypothetical protein  31.44 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3120  conserved hypothetical protein TIGR00370  31.44 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000284554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5124  hypothetical protein  39.55 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1957  Allophanate hydrolase subunit 1  37.73 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.360214  hitchhiker  0.00204684 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2922  Allophanate hydrolase subunit 1  38.54 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.820056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58530  hypothetical protein  38.81 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5727  allophanate hydrolase subunit 2  41.03 
 
 		 531 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506367  normal  0.818149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3056  allophanate hydrolase subunit 1  39.17 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0087  hypothetical protein  43.6 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0230  hypothetical protein  37.79 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0062  hypothetical protein  43.6 
 
 		 216 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0254  putative allophanate hydrolase, subunit 1  37.79 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2948  allophanate hydrolase subunit 1  38.71 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0899  Allophanate hydrolase subunit 1  39.23 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3311  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0449  hypothetical protein  37.79 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3367  putative allophanate hydrolase, subunit 1  37.5 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3082  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2981  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78206  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2111  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3032  allophanate hydrolase subunit 1  38.5 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0266  putative allophanate hydrolase, subunit 1  37.79 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251765  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1136  Allophanate hydrolase subunit 1  39.51 
 
 		 218 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2423  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3037  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1255  allophanate hydrolase subunit 1  36.54 
 
 		 218 aa  128  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0342486  normal  0.816656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6384  hypothetical protein  38.71 
 
 		 218 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3741  Allophanate hydrolase subunit 1  36.45 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.456378 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1713  hypothetical protein  31.58 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.115565  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1226  Allophanate hydrolase subunit 1  36.59 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1527  hypothetical protein  31.58 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2825  allophanate hydrolase subunit 1  34.05 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.140549  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2903  allophanate hydrolase subunit 1  37.5 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.282421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0869  hypothetical protein  37.81 
 
 		 549 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2224  allophanate hydrolase subunit 1  35.24 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1900  hypothetical protein  30.7 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0499  Urea amidolyase-related protein  38.66 
 
 		 534 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3110  Allophanate hydrolase subunit 1  35.12 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6350  Allophanate hydrolase subunit 1  35.81 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0025  allophanate hydrolase, subunit 1  40 
 
 		 215 aa  121  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2171  hypothetical protein  37.2 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.452484  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5380  allophanate hydrolase, putative  38.17 
 
 		 539 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0195  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2073  Allophanate hydrolase subunit 2  37 
 
 		 499 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.721268 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1828  Allophanate hydrolase subunit 1  31.92 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1978  Allophanate hydrolase subunit 1  33.33 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5847  hypothetical protein  36.7 
 
 		 541 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0879773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2450  allophanate hydrolase subunit 2  37.77 
 
 		 553 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.76901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1974  Allophanate hydrolase subunit 1  35.98 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1030  allophanate hydrolase subunit 1  33.48 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>