165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2553 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1533  glycosyl transferase family protein  73.84 
 
 		 584 aa  851    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.030992  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2917  glycosyl transferase family protein  90.69 
 
 		 580 aa  1032    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2544  glycosyl transferase family protein  78.31 
 
 		 581 aa  867    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.327974  normal  0.26724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2553  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 580 aa  1142    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2076  glycosyl transferase family protein  74.7 
 
 		 580 aa  857    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3917  glycosyl transferase family protein 39  75.73 
 
 		 580 aa  846    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2825  glycosyl transferase family 39  86.06 
 
 		 581 aa  937    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4551  glycosyl transferase family protein  47.42 
 
 		 577 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4686  glycosyl transferase family 39  44.17 
 
 		 598 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4173  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 		 602 aa  361  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6372  glycosyl transferase family protein  43.63 
 
 		 600 aa  359  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4542  glycosyl transferase family 39  42.91 
 
 		 602 aa  353  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0207348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5864  glycosyl transferase family protein  45.05 
 
 		 579 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0380825  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2164  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 		 573 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1888  glycosyl transferase family 39  38.16 
 
 		 552 aa  317  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0174434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0012  glycosyl transferase family protein  38.56 
 
 		 557 aa  306  1.0000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1482  glycosyl transferase family protein  37.68 
 
 		 547 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0380  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 		 570 aa  288  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4522  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185613  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2389  glycosyl transferase family protein  36.31 
 
 		 637 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.476236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  27.31 
 
 		 528 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1670  glycosyl transferase family 39  26.77 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000109819  normal  0.252715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3093  glycosyl transferase family 39  30.37 
 
 		 527 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.798071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0636  glycosyl transferase family 39  28.57 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1771  hypothetical protein  28.1 
 
 		 525 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  25.98 
 
 		 553 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3551  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 		 547 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.141392  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3694  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00440665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5072  family 39 glycosyl transferase  26.39 
 
 		 605 aa  97.4  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16511  glycosyltransferase  23.08 
 
 		 612 aa  93.6  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.760538  normal  0.297105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1145  glycosyl transferase family 39  26.55 
 
 		 519 aa  89.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107817  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0606  hypothetical protein  27.64 
 
 		 516 aa  89  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0432  glycosyl transferase family 39  21.55 
 
 		 611 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.623031  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12641  glycosyltransferase  25.13 
 
 		 604 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.547801  hitchhiker  0.00232598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1336  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 586 aa  88.6  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478809  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1278  hypothetical protein  24.59 
 
 		 601 aa  88.6  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0086  glycosyl transferase family 39  22.96 
 
 		 512 aa  88.2  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00741033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 554 aa  87.8  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0796  hypothetical protein  22.96 
 
 		 612 aa  87.4  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.886904  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2202  glycosyl transferase family 39  27.6 
 
 		 515 aa  87  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1034  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 631 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0453  glycosyl transferase family 39  27.71 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3801  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 		 666 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13781  glycosyltransferase  25.4 
 
 		 601 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.938605  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0276  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.71 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13491  glycosyltransferase  24.52 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0690  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 514 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13701  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  23.81 
 
 		 601 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6130  family 39 glycosyltransferase  25.43 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2925  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  25.2 
 
 		 563 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2540  glycosyl transferase family 39  25.2 
 
 		 563 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1778  hypothetical protein  26.05 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3979  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 		 573 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1273  glycosyltransferase  25.13 
 
 		 510 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0465  hypothetical protein  23.99 
 
 		 515 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0526  glycosyl transferase family 39  22.22 
 
 		 534 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4828  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  28.57 
 
 		 575 aa  73.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.277829  normal  0.0161554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  26.45 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3271  glycosyl transferase family 39  22.49 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4212  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.872167  normal  0.0154714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1864  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  23.01 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.516095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1354  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.92 
 
 		 556 aa  70.5  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.515777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1729  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02790  hypothetical protein  25.75 
 
 		 468 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2608  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1835  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590917  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4095  glycosyl transferase family 39  24.53 
 
 		 606 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0435  glycosyl transferase family protein  22.76 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2411  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.55 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2555  melittin resistance protein, putative  25.22 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5962  family 39 glycosyltransferase  25.83 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00513205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0441  glycosyl transferase family 39  23.49 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.421293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1440  glycosyl transferase family 39  24.29 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1411  glycosyl transferase family 39  24.29 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2633  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.27 
 
 		 550 aa  67  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.283519  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0648  family 39 glycosyl transferase  21.92 
 
 		 515 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1260  glycosyl transferase family 39  25.6 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367598  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06171  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.84 
 
 		 613 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0423817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2552  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.99 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02183  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.99 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1401  glycosyl transferase family 39  25.99 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1445  glycosyl transferase family 39  26.36 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02142  hypothetical protein  25.99 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2402  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.99 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.770556  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1392  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.99 
 
 		 550 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3398  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.99 
 
 		 550 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2075  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.31 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4587  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase famly protein  28.37 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.467811  hitchhiker  0.00235172 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2924  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  25.71 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2384  putative transmembrane protein  23.34 
 
 		 578 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1792  hypothetical protein  22.86 
 
 		 564 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.018276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 557 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2158  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.56 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1199  glycosyl transferase family 39  25.68 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0554948 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3628  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4300  glycosyl transferase family 39  26.82 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2529  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2645  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2437  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  26.93 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4228  4-amino-4-deoxy-L-arabinose transferase  24.38 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>