More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3086 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0723  ABC transporter related  63.29 
 
 		 599 aa  757    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0704  ABC transporter related  62.38 
 
 		 605 aa  750    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.041253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3808  ABC transporter related  60.48 
 
 		 606 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0349  ABC transporter related  63.37 
 
 		 602 aa  743    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0287299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3185  ABC transporter related  63.04 
 
 		 607 aa  728    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1753  ABC transporter, ATP-binding protein  62.31 
 
 		 605 aa  735    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0672  ABC transporter related  62.35 
 
 		 609 aa  699    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276337  normal  0.341528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0944  ABC transporter related  55.63 
 
 		 601 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1692  ABC transporter, ATP-binding protein  62.31 
 
 		 605 aa  735    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4261  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.89 
 
 		 609 aa  691    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2153  ABC transporter, ATPase subunit  82.1 
 
 		 602 aa  996    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2599  ABC transporter related  63.55 
 
 		 611 aa  776    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3520  ABC transporter related  59.61 
 
 		 602 aa  660    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3591  ABC transporter ATPase  80.23 
 
 		 606 aa  954    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386794  normal  0.0329455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1145  ABC transporter related  61.63 
 
 		 605 aa  728    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3202  ABC transporter related  79.97 
 
 		 603 aa  975    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1478  ABC transporter related  62.38 
 
 		 607 aa  672    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3086  ABC transporter related  100 
 
 		 609 aa  1233    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395233  normal  0.156942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3380  ABC transporter related  63.04 
 
 		 607 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0258636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3509  ABC transporter related  63.04 
 
 		 607 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0131  ABC transporter, ATP-binding protein  54.14 
 
 		 609 aa  660    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2484  ABC transporter related  77.67 
 
 		 605 aa  946    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2253  ABC transporter related  79.97 
 
 		 607 aa  969    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0543985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2552  ABC transporter related  81.94 
 
 		 604 aa  1008    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3104  ABC transporter related  58.89 
 
 		 608 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.73656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3404  ABC transporter related  59.08 
 
 		 604 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4137  ABC transporter related  58.79 
 
 		 605 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.245336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2632  ABC transporter related  60.07 
 
 		 602 aa  697    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.306904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1013  ABC transporter component  51.55 
 
 		 610 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2140  ABC transporter related  50.17 
 
 		 603 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.419129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2717  putative UUP ATPase  50.17 
 
 		 607 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1375  ABC transporter related  50.17 
 
 		 607 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0588139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1714  ABC-transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 614 aa  571  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0650863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0896  ABC transporter related  51.55 
 
 		 599 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0920  ABC transporter related  48.68 
 
 		 596 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1919  ABC transporter related  52.45 
 
 		 603 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.338599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3652  ABC transporter related  49.08 
 
 		 604 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3923  ABC transporter related  47.22 
 
 		 610 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  43.17 
 
 		 645 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1524  ABC transporter related  46.55 
 
 		 593 aa  464  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672162 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  42.25 
 
 		 641 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  42.95 
 
 		 648 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  42 
 
 		 649 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  41.41 
 
 		 640 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  42.48 
 
 		 649 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  42.45 
 
 		 642 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  42.39 
 
 		 649 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2068  ABC transporter related  44.87 
 
 		 598 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  42.39 
 
 		 661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  42.39 
 
 		 661 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  42.17 
 
 		 649 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3446  ABC transporter related  44.92 
 
 		 596 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  43.21 
 
 		 648 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  40.09 
 
 		 648 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  42.16 
 
 		 641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 648 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0660  ABC transporter related  42.72 
 
 		 626 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14515  normal  0.023928 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  39.69 
 
 		 648 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 660 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 648 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 648 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  39.51 
 
 		 653 aa  445  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  42.33 
 
 		 688 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  39.91 
 
 		 647 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 660 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 660 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 1065 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  42.76 
 
 		 636 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  42.76 
 
 		 663 aa  439  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  40.75 
 
 		 641 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  42.98 
 
 		 594 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  38.21 
 
 		 637 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  38.21 
 
 		 637 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  38.21 
 
 		 637 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  42.63 
 
 		 633 aa  429  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  38.91 
 
 		 642 aa  430  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  38.98 
 
 		 640 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0721  ABC transporter related  42.2 
 
 		 640 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  39.5 
 
 		 639 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  40.22 
 
 		 639 aa  429  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0838  ABC transporter related  41.8 
 
 		 646 aa  428  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0257096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  38.38 
 
 		 638 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0413  ABC transporter related  40.79 
 
 		 641 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00715783  hitchhiker  0.000000249616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  40.03 
 
 		 643 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  40.92 
 
 		 636 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  37.69 
 
 		 640 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  41.03 
 
 		 631 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1126  ABC transporter related  41.39 
 
 		 634 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.239651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  40.95 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4229  ABC transporter related  40.38 
 
 		 648 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.868359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  40.4 
 
 		 650 aa  420  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  39.04 
 
 		 639 aa  422  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  41.5 
 
 		 644 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 646 aa  419  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  36.92 
 
 		 640 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  37.07 
 
 		 640 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  39.78 
 
 		 637 aa  414  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  37.27 
 
 		 641 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2512  ABC transporter related  41.45 
 
 		 620 aa  412  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>