46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2509 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  100 
 
 		 480 aa  944    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  51.79 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  48.54 
 
 		 545 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  50.19 
 
 		 505 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  59.03 
 
 		 535 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  48.62 
 
 		 470 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  44.96 
 
 		 529 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  35.97 
 
 		 281 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  30.63 
 
 		 474 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  31.9 
 
 		 990 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  31.6 
 
 		 978 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  27.99 
 
 		 966 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  33.43 
 
 		 911 aa  97.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  30.55 
 
 		 993 aa  97.8  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  29.08 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  28.28 
 
 		 472 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  31.81 
 
 		 511 aa  90.1  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  31.76 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  43.02 
 
 		 1079 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  43.9 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  33.22 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  40.78 
 
 		 533 aa  73.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  40.74 
 
 		 1108 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  42.22 
 
 		 835 aa  70.5  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  37.63 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  32.35 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  43.04 
 
 		 727 aa  68.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  43.33 
 
 		 276 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  29.25 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  37.04 
 
 		 458 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  30.95 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  33.75 
 
 		 340 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  35.23 
 
 		 243 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  35 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  32.93 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 363 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0614  sporulation domain-containing protein  29.52 
 
 		 282 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 328 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 307 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 328 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 318 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  26.67 
 
 		 237 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  29.89 
 
 		 396 aa  44.3  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  34 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 198 aa  43.5  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>