More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1118 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0664  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.47 
 
 		 693 aa  939    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.18174 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1132  flagellar biosynthesis protein FlhA  70 
 
 		 723 aa  962    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.801341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0377  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.9 
 
 		 695 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.62 
 
 		 696 aa  992    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1700  flagellar biosynthesis protein FlhA  67.64 
 
 		 696 aa  925    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0772  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.62 
 
 		 696 aa  905    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.75 
 
 		 696 aa  969    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1118  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 		 695 aa  1396    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6515  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.6 
 
 		 693 aa  952    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0345  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.75 
 
 		 695 aa  890    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0272  flagellar biosynthesis protein FlhA  66.67 
 
 		 695 aa  924    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0701  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.03 
 
 		 693 aa  935    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0861258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0690  flagellar biosynthesis protein FlhA  68.18 
 
 		 693 aa  940    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0517685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0049  flagellar biosynthesis protein FlhA  70.26 
 
 		 696 aa  1016    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0283  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.47 
 
 		 695 aa  882    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.115308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1037  flagellar biosynthesis protein FlhA  69.12 
 
 		 684 aa  938    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.532359  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1160  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.71 
 
 		 694 aa  885    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.35 
 
 		 711 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.85 
 
 		 710 aa  577  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.66 
 
 		 720 aa  572  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.15 
 
 		 709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.53 
 
 		 711 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.3 
 
 		 744 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.4 
 
 		 710 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.66 
 
 		 745 aa  551  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3613  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.87 
 
 		 704 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3956  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.99 
 
 		 708 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.8 
 
 		 691 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0529  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.55 
 
 		 709 aa  544  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.09 
 
 		 714 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.81 
 
 		 682 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.79 
 
 		 715 aa  534  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.13 
 
 		 695 aa  533  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0819  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.4 
 
 		 713 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.51002 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3428  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 		 731 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.979458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0778  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.4 
 
 		 713 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0462178  normal  0.898381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1017  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.03 
 
 		 703 aa  515  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308757  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.82 
 
 		 696 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.12 
 
 		 694 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.65 
 
 		 694 aa  492  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.91 
 
 		 708 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.95 
 
 		 692 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.8 
 
 		 692 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.83 
 
 		 695 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.18 
 
 		 693 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.14 
 
 		 697 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.83 
 
 		 689 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.77 
 
 		 692 aa  465  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.25 
 
 		 696 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.3 
 
 		 699 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.35 
 
 		 690 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2953  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.55 
 
 		 696 aa  460  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2613  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.41 
 
 		 689 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186962 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3258  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.62 
 
 		 698 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.07 
 
 		 694 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.09 
 
 		 698 aa  457  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.8 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.05 
 
 		 686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.67 
 
 		 703 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.12 
 
 		 699 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.38 
 
 		 710 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 		 699 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.65 
 
 		 699 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.66 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.2 
 
 		 700 aa  452  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.18 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.38 
 
 		 693 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.28 
 
 		 699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.93 
 
 		 694 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.89 
 
 		 693 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.5 
 
 		 706 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.08 
 
 		 694 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.98 
 
 		 699 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.98 
 
 		 699 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  35.83 
 
 		 696 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4186  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.85 
 
 		 693 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.3 
 
 		 700 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.07 
 
 		 699 aa  443  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.96 
 
 		 708 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.74 
 
 		 695 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.62 
 
 		 680 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.98 
 
 		 699 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.15 
 
 		 700 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.83 
 
 		 699 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.34 
 
 		 703 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.391831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.48 
 
 		 702 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.76 
 
 		 700 aa  439  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.06 
 
 		 680 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0380  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.99 
 
 		 703 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.1 
 
 		 693 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.25 
 
 		 699 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.99 
 
 		 698 aa  439  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.54 
 
 		 699 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.45 
 
 		 708 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.72 
 
 		 697 aa  435  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.13 
 
 		 697 aa  435  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.42 
 
 		 690 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.05 
 
 		 700 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.87 
 
 		 697 aa  432  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>