56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0144 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0144  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  100 
 
 		 275 aa  577  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5775  hypothetical protein  31.28 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.314122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0266  hypothetical protein  31.35 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1597  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.67 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.417903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2483  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  28.2 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000992077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4725  putative Sir2-like transcriptional silencer protein  29.08 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045977 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1653  hypothetical protein  29.52 
 
 		 500 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.189804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0142  hypothetical protein  32.56 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0145  hypothetical protein  30.43 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.185076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0156  hypothetical protein  30.43 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0138  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  27.19 
 
 		 484 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1037  hypothetical protein  29.52 
 
 		 477 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.960638  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6511  hypothetical protein  28.02 
 
 		 497 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2020  hypothetical protein  27.56 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0373  hypothetical protein  26.98 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  29.73 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3361  hypothetical protein  29.25 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  28.22 
 
 		 479 aa  66.2  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0167  hypothetical protein  24.63 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.427298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3820  hypothetical protein  22.93 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0072  hypothetical protein  26.13 
 
 		 838 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.661071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004333  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1199 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330356  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5662  hypothetical protein  24.78 
 
 		 442 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01367  hypothetical protein  24.9 
 
 		 459 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.667542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3377  phage protein  26.42 
 
 		 516 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00845273  hitchhiker  0.00000000000000133815 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  26.52 
 
 		 518 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6572  hypothetical protein  30.56 
 
 		 358 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102603  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17060  hypothetical protein  24.32 
 
 		 294 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3403  hypothetical protein  24.66 
 
 		 532 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00805318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0550  hypothetical protein  31.73 
 
 		 537 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  24.07 
 
 		 514 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0345  hypothetical protein  24.64 
 
 		 474 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0100  hypothetical protein  29.52 
 
 		 541 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0535772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2550  hypothetical protein  24.8 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4003  hypothetical protein  22.66 
 
 		 906 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2355  hypothetical protein  27.85 
 
 		 534 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.750444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  24.9 
 
 		 435 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6920  hypothetical protein  25.91 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0731  hypothetical protein  31.65 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0866  hypothetical protein  21.63 
 
 		 511 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0849  hypothetical protein  21.63 
 
 		 480 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0228  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  22.62 
 
 		 1036 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5667  hypothetical protein  25.74 
 
 		 746 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.627177  normal  0.0881924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0957  hypothetical protein  24.64 
 
 		 452 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  24.45 
 
 		 441 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0855  hypothetical protein  23.29 
 
 		 511 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.823491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2928  hypothetical protein  26.05 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1068  hypothetical protein  26.53 
 
 		 480 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2015  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1166 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0925  hypothetical protein  21.08 
 
 		 461 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.841538  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1324  hypothetical protein  24.04 
 
 		 716 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.772779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2653  phage protein  27.27 
 
 		 538 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0454  phage protein  27.27 
 
 		 538 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2750  hypothetical protein  23.73 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.595373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2961  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1160 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>