216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3794 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4432  flagellar basal body P-ring protein  95.65 
 
 		 373 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3794  flagellar basal body P-ring protein  100 
 
 		 373 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1497  flagellar basal body P-ring protein  89.28 
 
 		 378 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1677  flagellar basal body P-ring protein  97.05 
 
 		 373 aa  677    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0126044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5520  flagellar basal body P-ring protein  89.89 
 
 		 374 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1111  flagellar basal body P-ring protein  90.78 
 
 		 374 aa  627  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.286813  normal  0.222174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1344  flagellar basal body P-ring protein  91.67 
 
 		 374 aa  610  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4706  flagellar basal body P-ring protein  76.66 
 
 		 377 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0381721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5550  flagellar basal body P-ring protein  75.36 
 
 		 378 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.987081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4190  flagellar basal body P-ring protein  75.65 
 
 		 371 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.525763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3265  flagellar basal body P-ring protein  70.33 
 
 		 380 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3041  flagellar basal body P-ring protein  70.05 
 
 		 380 aa  524  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3238  flagellar basal body P-ring protein  72.09 
 
 		 376 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2556  flagellar P-ring protein  62.43 
 
 		 378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2849  flagellar basal body P-ring protein  59.24 
 
 		 383 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0378729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1952  flagellar basal body P-ring protein  56.03 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3689  flagellar basal body P-ring protein  56 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0760  flagellar basal body P-ring protein  54.74 
 
 		 384 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0434  flagellar basal body P-ring protein  54.07 
 
 		 365 aa  354  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3678  flagellar basal body P-ring protein  52.3 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.970416  hitchhiker  0.00678684 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3047  flagellar basal body P-ring protein  53.78 
 
 		 368 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3097  flagellar basal body P-ring protein  51.65 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3432  flagellar basal body P-ring protein  51.52 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3843  flagellar basal body P-ring protein  50.87 
 
 		 398 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1687  flagellar basal body P-ring protein  50.86 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0208873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3452  flagellar basal body P-ring protein  51.37 
 
 		 364 aa  345  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2004  flagellar basal body P-ring protein  48.74 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2699  flagellar basal body P-ring protein  52.62 
 
 		 366 aa  345  7e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3651  flagellar basal body P-ring protein  50.82 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  0.909314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3759  flagellar basal body P-ring protein  50.29 
 
 		 398 aa  344  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0029  flagellar basal body P-ring protein  51.57 
 
 		 367 aa  342  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2942  flagellar basal body P-ring protein  50.82 
 
 		 367 aa  342  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.984574  normal  0.211338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4103  flagellar basal body P-ring protein  51.45 
 
 		 368 aa  342  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0569216  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2406  flagellar basal body P-ring protein  49.85 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0601  flagellar basal body P-ring protein  48.46 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.139289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0634  flagellar basal body P-ring protein  48.61 
 
 		 375 aa  339  5e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152103  normal  0.0964958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1307  flagellar basal body P-ring protein  50.97 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0623  flagellar basal body P-ring protein  48.33 
 
 		 375 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704144  normal  0.127311 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0156  flagellar basal body P-ring protein  47.71 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.706298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2966  flagellar basal body P-ring protein  50.69 
 
 		 363 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1099  flagellar basal body P-ring protein  52.39 
 
 		 367 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4207  flagellar basal body P-ring protein  47.71 
 
 		 413 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1139  flagellar basal body P-ring protein  47.84 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1153  flagellar basal body P-ring protein  48.55 
 
 		 367 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3278  flagellar basal body P-ring protein  49.71 
 
 		 363 aa  329  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3376  flagellar basal body P-ring protein  48.35 
 
 		 367 aa  328  7e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0597  flagellar P-ring protein  46.63 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2739  flagellar basal body P-ring protein  50.42 
 
 		 365 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4176  flagellar basal body P-ring protein  48.9 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2425  flagellar basal body P-ring protein  49.73 
 
 		 378 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.320563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0354  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0346508 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0322  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 		 373 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0293  flagellar basal body P-ring protein  47.99 
 
 		 369 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0260  flagellar basal body P-ring protein  49.17 
 
 		 371 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1352  flagellar basal body P-ring protein  47.21 
 
 		 363 aa  316  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1504  flagellar basal body P-ring protein  48.13 
 
 		 362 aa  316  5e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2521  flagellar basal body P-ring protein  51.02 
 
 		 374 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1769  flagellar P-ring protein  47.25 
 
 		 372 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2509  flagellar basal body P-ring protein  48.84 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.296708  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2371  flagellar basal body P-ring protein  47.69 
 
 		 367 aa  312  6.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1328  flagellar basal body P-ring protein  47.08 
 
 		 363 aa  311  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3944  flagellar basal body P-ring protein  46.54 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0742  flagellar basal body P-ring protein  48.1 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2605  flagellar basal body P-ring protein  48.98 
 
 		 372 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0976186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3724  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3242  flagellar basal body P-ring protein  44.97 
 
 		 363 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4383  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1472  flagellar basal body P-ring protein  46.26 
 
 		 369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.01106  normal  0.415851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1942  flagellar P-ring protein FlgI  45.41 
 
 		 369 aa  308  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152396  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1224  flagellar P-ring protein  47.18 
 
 		 380 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.794178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2590  flagellar basal body P-ring protein  46.35 
 
 		 363 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3473  flagellar basal body P-ring protein  45.68 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1971  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1604  flagellar basal body P-ring protein  47.52 
 
 		 363 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0616045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2331  flagellar basal body P-ring protein  48.6 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1266  flagellar basal body P-ring protein  46.65 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1336  flagellar basal body P-ring protein  46.65 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1109  flagellar basal body P-ring protein  45.94 
 
 		 365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1785  flagellar basal body P-ring protein  49.13 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1348  flagellar basal body P-ring protein  48.4 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0028496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2404  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3018  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0546214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3037  flagellar basal body P-ring protein  46.56 
 
 		 391 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1467  flagellar basal body P-ring protein  46.41 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2843  flagellar basal body P-ring protein  46.17 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.251575  normal  0.108847 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0933  flagellar P-ring protein  47.26 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3013  flagellar basal body P-ring protein  46.23 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6364  flagellar basal body P-ring protein  47.89 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2206  flagellar basal body P-ring protein  48.09 
 
 		 379 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.988864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3080  flagellar basal body P-ring protein  46.48 
 
 		 363 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3001  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 401 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2092  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 400 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3093  flagellar basal body P-ring protein  46.06 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1423  flagellar basal body P-ring protein  46.06 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.769389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2955  flagellar basal body P-ring protein  46.06 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.667376  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2940  flagellar basal body P-ring protein  46.06 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3332  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 397 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3347  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 394 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0273  flagellar basal body P-ring protein  47.47 
 
 		 400 aa  301  9e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1347  flagellar basal body P-ring protein  44.54 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>