33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2862 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2862  cytochrome c, class I  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0699705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1738  cytochrome c, class I  83.21 
 
 		 275 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3572  hypothetical protein  64.89 
 
 		 272 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1419  cytochrome c  65.04 
 
 		 266 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1450  cytochrome c  66.67 
 
 		 266 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.901546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2593  hypothetical protein  62.98 
 
 		 269 aa  340  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.572119  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42120  hypothetical protein  64.53 
 
 		 273 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1841  cytochrome c family protein  64.23 
 
 		 266 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.858581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3869  hypothetical protein  64.23 
 
 		 266 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.064259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23840  Cytochrome c, class I  62.5 
 
 		 268 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3154  signal peptide protein  46.07 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.430229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1946  cytochrome c, class I  43.45 
 
 		 277 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3509  cytochrome c, class I  43.98 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4362  cytochrome c, class I  43.43 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4098  cytochrome c, class I  43.87 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.982454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4268  cytochrome c, class I  43.87 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3425  cytochrome c class I  43.87 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4008  hypothetical protein  43.82 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3894  hypothetical protein  43.82 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.463258 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3992  cytochrome c class I  43.23 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08341  normal  0.223364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4489  cytochrome c class I  42.29 
 
 		 280 aa  194  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.519402 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4636  putative cytochrome c  40.93 
 
 		 290 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.305969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1608  cytochrome c, class I  28.92 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1775  cytochrome c family protein  28.76 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0760  cytochrome c, class I  28.41 
 
 		 101 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.957716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3866  cytochrome c class I  32 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  23.89 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0824  cytochrome c class I  45.45 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000780419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1798  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.04 
 
 		 292 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  31.07 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.87 
 
 		 349 aa  43.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  23.56 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  29.47 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0912153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>