More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0996 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  86.05 
 
 		 259 aa  455  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  53.75 
 
 		 278 aa  285  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  51.42 
 
 		 266 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  51.37 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  50.98 
 
 		 260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  47.45 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  45.35 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  49.58 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  49.16 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  49.16 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  49.16 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  47.92 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  49.16 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  48.74 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  48.74 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  48.74 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  50.59 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  47.26 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  34.41 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  31.15 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  31.97 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  34.15 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  28.51 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.08 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.95 
 
 		 393 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  31.66 
 
 		 397 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  32.39 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  31.47 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.71 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.71 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.07 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  32.67 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  32.93 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 270 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  30.24 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.85 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.07 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  29.55 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.98 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.39 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.74 
 
 		 392 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.3 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  29.57 
 
 		 270 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 265 aa  85.5  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.29 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  27.89 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  27.63 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  27.63 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.89 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  31.8 
 
 		 275 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>