93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0612 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  88.8 
 
 		 253 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  45.56 
 
 		 494 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  39.37 
 
 		 504 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  40.08 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  40.08 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  38.93 
 
 		 241 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  31.74 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  29.72 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  30.26 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  32.03 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  30.68 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  28.43 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  27.65 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  31.52 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  30 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  30.56 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 329 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  26.1 
 
 		 529 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 331 aa  95.1  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  28.8 
 
 		 548 aa  92  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  29.17 
 
 		 330 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  28.96 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  28.98 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  27.87 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  27.76 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  28.11 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  25.46 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  26.58 
 
 		 325 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0020  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.77 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.583446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.25 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0077  nucleotidyl transferase  29.6 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.760983 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  28.57 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  23.72 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  26.73 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  23.53 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  24.79 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  23.32 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  20.83 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  26.89 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0729  Nucleotidyl transferase  25.45 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  27.19 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  25.11 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1604  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  26.37 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0276  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.61 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00854948  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.08 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  28.25 
 
 		 854 aa  55.8  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 835 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.59 
 
 		 344 aa  50.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  26.84 
 
 		 364 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0639  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.97 
 
 		 447 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0152266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.4 
 
 		 376 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 370 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.7 
 
 		 355 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  26.87 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  25.41 
 
 		 359 aa  45.8  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  26.7 
 
 		 370 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  27.4 
 
 		 351 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  20 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.49 
 
 		 776 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.57 
 
 		 357 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.74 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0378  Nucleotidyl transferase  23.64 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0925402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  28.07 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.23 
 
 		 842 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.72 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  27.62 
 
 		 358 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.09 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1890  nucleotidyl transferase  23.81 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.661089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  22.91 
 
 		 833 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0234  Nucleotidyl transferase  29.93 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  25.14 
 
 		 361 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  27.62 
 
 		 359 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.7 
 
 		 355 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.81 
 
 		 356 aa  42.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  23.81 
 
 		 364 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.69 
 
 		 355 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  25.28 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2041  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.95 
 
 		 561 aa  42.4  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1992  aminoglycoside phosphotransferase  24.6 
 
 		 581 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.775829  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0518  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.43 
 
 		 561 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.815966  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0324  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.43 
 
 		 453 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3380  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.43 
 
 		 453 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00368605  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  27.72 
 
 		 360 aa  42.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2243  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.43 
 
 		 453 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.164463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0337  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.43 
 
 		 453 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.116008  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3051  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.43 
 
 		 453 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.4 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0186  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.18 
 
 		 454 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  27.92 
 
 		 228 aa  42.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.11 
 
 		 355 aa  42  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>