276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0872 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0872  OmpA/MotB  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178766  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0850  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.87 
 
 
212 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.720569  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  35.38 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31110  flagellar motor protein  29.88 
 
 
295 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.529946  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  34.68 
 
 
463 aa  63.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  34.4 
 
 
257 aa  62.4  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  33.06 
 
 
343 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2103  hypothetical protein  28.85 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  33.87 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  27.93 
 
 
259 aa  61.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  33.87 
 
 
343 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  26.79 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  31.45 
 
 
314 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  31.45 
 
 
343 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  30.72 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2937  OmpA/MotB domain-containing protein  25.85 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.611007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  29.25 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  33.88 
 
 
299 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  31.88 
 
 
306 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  31.55 
 
 
271 aa  58.2  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  27.93 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  27.93 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0030  OmpA/MotB domain protein  31.58 
 
 
271 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  34.88 
 
 
256 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0654  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 
275 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1744  flagellar motor protein MotD  36.67 
 
 
273 aa  57  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1744  flagellar motor protein MotD  36.67 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1997  OmpA/MotB domain protein  33.05 
 
 
300 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4600  OmpA/MotB domain protein  26.73 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  30.22 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  32.26 
 
 
343 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  26.29 
 
 
251 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1107  flagellar motor protein MotB  35.94 
 
 
423 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 
259 aa  55.8  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  27.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  27.93 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  27.14 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  31.25 
 
 
343 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04090  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  28.57 
 
 
430 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  27.37 
 
 
225 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  27.37 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  27.37 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  27.37 
 
 
225 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  27.37 
 
 
225 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0610  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 
470 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0096444  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.92 
 
 
494 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  26.7 
 
 
434 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  32.28 
 
 
329 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0495  OmpA/MotB domain-containing protein  32.54 
 
 
238 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.665568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  32.06 
 
 
313 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  29.84 
 
 
525 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  29.84 
 
 
525 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  30.68 
 
 
283 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0642  OmpA/MotB domain protein  34.01 
 
 
462 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0469396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0834  flagellar motor protein MotB  34.65 
 
 
280 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  32.06 
 
 
254 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0631  OmpA/MotB domain-containing protein  34.01 
 
 
468 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  0.662195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 
340 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  28.67 
 
 
343 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  29.17 
 
 
337 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  26.26 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  30.14 
 
 
342 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  31.4 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  29.84 
 
 
525 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  23.22 
 
 
235 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3218  flagellar motor protein MotB  31.4 
 
 
329 aa  52.4  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  28.68 
 
 
252 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  30.83 
 
 
305 aa  52  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  23.72 
 
 
235 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  27.97 
 
 
342 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  23.72 
 
 
235 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  31.3 
 
 
253 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2442  OmpA/MotB domain-containing protein  27.44 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346518  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04949  flagellar motor protein  27.85 
 
 
330 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  30.77 
 
 
288 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  31.25 
 
 
265 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1375  putative flagellar motor protein (MotB)  25.35 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  32.64 
 
 
337 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03061  hypothetical protein  27.67 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  29.92 
 
 
342 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3239  hypothetical protein  25.12 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  25.12 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0359  OmpA/MotB  26.7 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1950  OmpA/MotB  35.94 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2336  OmpA/MotB domain protein  26.56 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.279433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  29.75 
 
 
323 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1071  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 
272 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.230641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  27.89 
 
 
305 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
270 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  34.43 
 
 
242 aa  49.3  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  26.85 
 
 
323 aa  48.9  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  26.06 
 
 
287 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  32.54 
 
 
275 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  31.9 
 
 
469 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 
296 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5728  OmpA/MotB domain protein  32 
 
 
294 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0122218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  29.65 
 
 
360 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0154  chemotaxis lafU protein  30.88 
 
 
311 aa  48.9  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>