More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0631 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0610  OmpA/MotB domain protein  82.82 
 
 
470 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0096444  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0642  OmpA/MotB domain protein  96.58 
 
 
462 aa  797    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0469396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0631  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
468 aa  928    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  0.662195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3223  OmpA/MotB domain-containing protein  56.99 
 
 
441 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0223192  normal  0.943443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1679  OmpA/MotB domain-containing protein  46.37 
 
 
401 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0303068 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1107  flagellar motor protein MotB  42.89 
 
 
423 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2687  OmpA/MotB domain-containing protein  37.34 
 
 
416 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.826191  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0284  flagellar motor protein MotB  39.29 
 
 
452 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0333  flagellar motor protein MotB  36.13 
 
 
447 aa  243  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0365  flagellar motor protein MotB  36.73 
 
 
443 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0756  flagellar motor protein MotB  35.24 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4198  flagellar motor protein MotB  62.88 
 
 
371 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.416203  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1144  flagellar motor protein MotB  61.36 
 
 
366 aa  181  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0037  OmpA/MotB domain protein  55.7 
 
 
402 aa  179  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0271  flagellar motor protein MotB  57.26 
 
 
397 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0757415  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1127  putative flagellar motor protein MotB  53.17 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0226  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 
346 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1321  chemotaxis MotB protein  34.3 
 
 
290 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1901  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 
371 aa  99  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3946  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
306 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0055  OmpA/MotB domain-containing protein  34.42 
 
 
336 aa  94.4  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0049  OmpA/MotB  34.42 
 
 
336 aa  93.6  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24330  Flagellar motor protein  53.75 
 
 
306 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3453  OmpA/MotB domain protein  43.41 
 
 
368 aa  90.9  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1843  OmpA/MotB  35.54 
 
 
360 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3447  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 
305 aa  90.1  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.284418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0577  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 
325 aa  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0523993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2976  flagellar motor protein MotB  41.73 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1000  OmpA/MotB domain-containing protein  35.26 
 
 
320 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2138  flagellar motor protein MotB  35.4 
 
 
309 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.171106  hitchhiker  1.07849e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2083  flagellar motor protein MotB  35.4 
 
 
309 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.375305  hitchhiker  2.85081e-24 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1322  flagellar motor protein MotB  35.4 
 
 
309 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.300198  hitchhiker  5.1879400000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2078  flagellar motor protein MotB  35.4 
 
 
309 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000517437  hitchhiker  0.0000035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1978  OmpA/MotB domain-containing protein  56.52 
 
 
286 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0364656  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1199  flagellar motor protein MotB  35.4 
 
 
309 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00894206  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2267  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
312 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1036  OmpA/MotB domain protein  34.48 
 
 
358 aa  88.2  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0662  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2239  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
312 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1939  flagellar motor protein MotB  62.3 
 
 
308 aa  87.8  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0731  hypothetical protein  37.06 
 
 
303 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0200  hypothetical protein  37.06 
 
 
303 aa  87.8  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0382119 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1244  flagellar motor protein MotB  35.9 
 
 
319 aa  87.4  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0079  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
340 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3857  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
340 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.347462  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3184  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
344 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12888  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3688  flagellar motor protein MotB  39.06 
 
 
325 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.45 
 
 
264 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.300073  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3938  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
340 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249786  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0180  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
339 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1259  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 
334 aa  87  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.541326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2791  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.33 
 
 
318 aa  87  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.426282  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0167  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
339 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.850348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2886  OmpA/MotB domain-containing protein  55.07 
 
 
298 aa  86.7  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2919  OmpA/MotB  36.72 
 
 
287 aa  86.7  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3817  flagellar motor protein MotB  40.34 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2986  OmpA/MotB domain-containing protein  51.43 
 
 
321 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543248  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01860  flagellar motor protein MotB  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0228996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1751  OmpA/MotB domain protein  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0290183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2122  flagellar motor protein MotB  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245861  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1985  flagellar motor protein MotB  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000595029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0163  flagellar motor protein MotB  32.77 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.724048  normal  0.748844 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3356  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828163  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2628  flagellar motor protein MotB  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00566133  hitchhiker  0.0000000000155511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01849  hypothetical protein  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0472674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1295  flagellar motor protein MotB  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00197011  hitchhiker  0.000000685167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1743  flagellar motor protein MotB  34.16 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1682  putative chemotaxis MotB protein  37.01 
 
 
245 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3437  flagellar motor protein  37.01 
 
 
245 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0236  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.501076  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2853  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0254  flagellar motor protein MotB  56.52 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1434  OmpA/MotB  31.87 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 
299 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0193  OmpA/MotB domain-containing protein  37.3 
 
 
313 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0723  flagellar motor protein MotB  34.64 
 
 
316 aa  84  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0275  hypothetical protein  29.1 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0284  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.179878  normal  0.584147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4286  flagellar motor protein MotB  37.68 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5682  flagellar motor protein MotB  30.77 
 
 
342 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1748  flagellar motor protein MotB  50 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.540445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0258  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0264  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3350  hypothetical protein  29.1 
 
 
307 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3377  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1539  flagellar motor protein MotB  64.06 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.074747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4204  OmpA/MotB domain-containing protein  34.42 
 
 
327 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2826  flagellar motor protein MotB  50 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.156984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1308  flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 
308 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5983  OmpA/MotB domain protein  39.23 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180638  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2467  flagellar motor protein MotB  32.92 
 
 
309 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0620427  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0117  flagellar motor protein MotB  55.22 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1637  flagellar motor protein MotB  50 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0625  flagellar motor protein MotB  59.68 
 
 
329 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65430  flagellar motor protein MotB  30.77 
 
 
347 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1511  flagellar motor protein MotB  64.06 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03067  flagellar motor protein MotB  52.17 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3816  OmpA/MotB domain-containing protein  56.52 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4409  OmpA/MotB domain-containing protein  56.52 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4696  flagellar motor protein MotB  59.68 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>