More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4804 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4804  aldo/keto reductase  100 
 
 		 270 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4932  aldo/keto reductase  98.52 
 
 		 270 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4981  aldo/keto reductase  96.3 
 
 		 270 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0534  aldo/keto reductase  93.33 
 
 		 270 aa  510  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.043929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0486  aldo/keto reductase  83.33 
 
 		 270 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4981  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  79.78 
 
 		 271 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0539  aldo/keto reductase  78.65 
 
 		 271 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44630  Aldo/keto reductase family protein  78.44 
 
 		 272 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0940461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66010  hypothetical protein  77.9 
 
 		 270 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0637322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5727  hypothetical protein  78.65 
 
 		 270 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0615  aldo/keto reductase  80.56 
 
 		 270 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1959  aldo/keto reductase  43.91 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  32.88 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  39.13 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  37.68 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  35.41 
 
 		 327 aa  99  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4912  aldo/keto reductase  33.81 
 
 		 298 aa  98.6  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0730904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  36.71 
 
 		 329 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  31.25 
 
 		 317 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  39.75 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  30.63 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  31.63 
 
 		 327 aa  95.1  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  34.08 
 
 		 332 aa  94  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  30 
 
 		 314 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  33.8 
 
 		 330 aa  93.2  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  32.49 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  30.8 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  31.2 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0361  aldo/keto reductase  31.22 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  31.53 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  29.74 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  37.33 
 
 		 331 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4507  oxidoreductase (related to aryl-alcohol dehydrogenase)-like protein  26.38 
 
 		 431 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  31.88 
 
 		 329 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  32.08 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.34 
 
 		 335 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  32.31 
 
 		 326 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 334 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  35.12 
 
 		 341 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  31.71 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1138  oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  33.8 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 348 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  30.32 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  35.37 
 
 		 349 aa  87.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.51 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  30.67 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2667  aldo/keto reductase  34.98 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.804175  normal  0.0176186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.51 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  31.51 
 
 		 322 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  28.77 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  34.51 
 
 		 351 aa  87  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  26.95 
 
 		 326 aa  87  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  30.77 
 
 		 343 aa  86.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  29.26 
 
 		 340 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  34.53 
 
 		 353 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  37.16 
 
 		 341 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  30.83 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.33 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  29.09 
 
 		 340 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  29.77 
 
 		 328 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  28.21 
 
 		 351 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4206  lolS protein  33.33 
 
 		 304 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.510794  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  30.68 
 
 		 342 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  31.28 
 
 		 323 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  30.38 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  35.62 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  33.48 
 
 		 338 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  29.17 
 
 		 350 aa  85.5  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  36.56 
 
 		 317 aa  85.5  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  31.49 
 
 		 336 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  30.64 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  31.92 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  31.92 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  29.1 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  26.83 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  33.03 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  30.59 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  29.68 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.88 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  30.64 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.88 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  38.04 
 
 		 333 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.88 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  31.6 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  33.16 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  31.7 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0527  aldo/keto reductase  34.23 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.712224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  39.38 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  34.88 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  31.95 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.48 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4229  lolS protein  35.37 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>