More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2074 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2074  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 		 330 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3146  ribosome small subunit-dependent GTPase A  62.09 
 
 		 307 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.79305  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1115  ribosome small subunit-dependent GTPase A  63.36 
 
 		 306 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  36.65 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4951  hypothetical protein  37.97 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0563  ribosome-associated GTPase  37.97 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  38.64 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  37.27 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0537  hypothetical protein  38.25 
 
 		 299 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  35.81 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.95 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4779  ribosome-associated GTPase  36.95 
 
 		 343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  35.93 
 
 		 343 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4955  ribosome-associated GTPase  36.27 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  38.49 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  38.14 
 
 		 339 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  29.49 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  32 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  32.39 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  32.39 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  32.39 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.02 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  32.39 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  30.23 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  30.23 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  33.07 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  30.23 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.07 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1503  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.42 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.29 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  28.85 
 
 		 352 aa  153  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  29.14 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.16 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.16 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1373  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.1 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  32.79 
 
 		 354 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3336  ribosome-associated GTPase  33.76 
 
 		 347 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.14191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  39.91 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  35.71 
 
 		 340 aa  149  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  36.91 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.77 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  32.29 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3154  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.11 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496758 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3033  ribosome-associated GTPase  32.11 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2777  ribosome-associated GTPase  34.2 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0423  ribosome-associated GTPase  32.83 
 
 		 349 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000942768  hitchhiker  0.000000790004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  30.53 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.3 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  31.25 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  33.59 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  33.59 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  33.59 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  33.06 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  39.22 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.37 
 
 		 300 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.93 
 
 		 292 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  32.69 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.84 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.84 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  33.91 
 
 		 315 aa  142  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0475  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  32.46 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13510  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000813715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  32.46 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2784  ribosome-associated GTPase  33.07 
 
 		 351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.21 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.68 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0386  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1850  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.055373 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00550  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  32.17 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002251  ribosome small subunit-stimulated GTPase EngC  35.17 
 
 		 354 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00154868  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.26 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4194  GTPase EngC  34.77 
 
 		 350 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.367616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  32.09 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  32.09 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.12 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0890  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.73 
 
 		 364 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  32.09 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  32.09 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.1 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  32.09 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.16 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  34.62 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2799  hypothetical protein  32.44 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2720  hypothetical protein  33.98 
 
 		 369 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000228616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  34.02 
 
 		 372 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2668  hypothetical protein  32.44 
 
 		 325 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1138  ribosome small subunit-dependent GTPase A  31.29 
 
 		 359 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2742  ribosome-associated GTPase  34.47 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201123  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0952  ribosome-associated GTPase  31.68 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1516  ribosome small subunit-dependent GTPase A  34.26 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000547316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0956  ribosome-associated GTPase  31.68 
 
 		 313 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>