More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4754 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4754  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 365 aa  728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  61.14 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  52.2 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.3 
 
 		 472 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 509 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 509 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  44.48 
 
 		 485 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 509 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 517 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  42.62 
 
 		 520 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 496 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 491 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.31 
 
 		 485 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.62 
 
 		 503 aa  243  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 504 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 509 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 		 488 aa  242  9e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 494 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 494 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  41.26 
 
 		 520 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  42.82 
 
 		 496 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 492 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  41.21 
 
 		 509 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.03 
 
 		 496 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 507 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 507 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  42.98 
 
 		 495 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 494 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 494 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 491 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.43 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  42.9 
 
 		 494 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  44.6 
 
 		 493 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  43.66 
 
 		 481 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 506 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  44.32 
 
 		 570 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6219  putative transcriptional regulator  43.85 
 
 		 491 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 506 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.4 
 
 		 488 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 506 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 509 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  40.4 
 
 		 475 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 502 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 502 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 502 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 507 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 495 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1143  GntR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 480 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130039  normal  0.465175 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 503 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 562 aa  229  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  39 
 
 		 511 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  45.4 
 
 		 488 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 473 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 490 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.34 
 
 		 486 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 502 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 564 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.74 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.95 
 
 		 499 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.44 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 564 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 502 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 503 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 546 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  38.8 
 
 		 561 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 564 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 564 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  40.05 
 
 		 504 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 574 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 476 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 490 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  41.36 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 504 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 470 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 496 aa  225  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 513 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.79 
 
 		 495 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 492 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  37.43 
 
 		 521 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.29 
 
 		 499 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.08 
 
 		 497 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>