44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4282 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4282  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  724    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.551761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2233  hypothetical protein  37.92 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1140  putative ATP-binding protein  35.25 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2687  putative ATP-binding protein  28.49 
 
 		 355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.815306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0648  AAA ATPase  32 
 
 		 340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1679  hypothetical protein  32.2 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489043 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5454  ATP-binding protein  30.77 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2637  putative ATP-binding protein  33 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592528  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0666  DNA replication and repair protein RecF  28.23 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0186794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0568  DNA replication and repair protein RecF  28.16 
 
 		 340 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3188  putative ATP-binding protein  28.21 
 
 		 344 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.636765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1745  hypothetical protein  26.32 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814918  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0350  putative ATP-binding protein  31.03 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  normal  0.712412 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3733  hypothetical protein  26.69 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.584646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3230  hypothetical protein  35.09 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  28.1 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  26.92 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  28.7 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  28.7 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  26.92 
 
 		 467 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2197  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.91 
 
 		 551 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  55.26 
 
 		 564 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.79 
 
 		 595 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  22.69 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  35.19 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  32.81 
 
 		 459 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2008  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 		 551 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.19 
 
 		 551 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  35.19 
 
 		 478 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2073  ATPase-like protein  23.13 
 
 		 497 aa  46.6  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.672394  normal  0.790362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 551 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  32.91 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.02 
 
 		 551 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  32.79 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1517  hypothetical protein  40.98 
 
 		 556 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.019243  normal  0.812738 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  24.71 
 
 		 435 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  34.18 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  26.73 
 
 		 513 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3414  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 		 555 aa  43.5  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106241  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0471  hypothetical protein  37.14 
 
 		 533 aa  43.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0692558  decreased coverage  0.00000000612882 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  34.18 
 
 		 408 aa  43.1  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1481  hypothetical protein  37.7 
 
 		 140 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  28.75 
 
 		 461 aa  42.7  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>