239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3058 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3058  pyridoxine 5'-phosphate synthase  100 
 
 
276 aa  571  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3632  pyridoxine 5'-phosphate synthase  82.31 
 
 
271 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.757255  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1752  pyridoxine 5'-phosphate synthase  72.58 
 
 
252 aa  367  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.736096  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2616  pyridoxine 5'-phosphate synthase  70 
 
 
259 aa  358  4e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3263  pyridoxine 5'-phosphate synthase  69.6 
 
 
259 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0574921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5258  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.75 
 
 
257 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2344  pyridoxine 5'-phosphate synthase  68.56 
 
 
262 aa  348  6e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.954303  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0595  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.93 
 
 
268 aa  341  5.999999999999999e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1405  pyridoxine 5'-phosphate synthase  71.49 
 
 
254 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1199  pyridoxine 5'-phosphate synthase  66.53 
 
 
258 aa  325  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.39444  decreased coverage  0.00461164 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0653  pyridoxine 5'-phosphate synthase  64.71 
 
 
265 aa  322  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0178796  normal  0.245911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2318  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  60.96 
 
 
255 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0014  pyridoxine 5'-phosphate synthase  54.69 
 
 
247 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104614 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03472  pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.99 
 
 
255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1713  pyridoxine 5'-phosphate synthase  51.84 
 
 
251 aa  224  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.61 
 
 
260 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0740712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0046  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.22 
 
 
260 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.52 
 
 
241 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3677  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.72 
 
 
240 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1695  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.44 
 
 
237 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1493  pyridoxine 5'-phosphate synthase  49.59 
 
 
248 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4990  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  43.48 
 
 
245 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.128156  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2038  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.82 
 
 
245 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.371359  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_002950  PG0630  pyridoxine 5'-phosphate synthase  45.23 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.377308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4728  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.74 
 
 
239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2794  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.59 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0224689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1982  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46 
 
 
250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2768  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.99 
 
 
250 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  0.550753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2512  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.8 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04340  putative pyridoxine biosynthesis protein  42.68 
 
 
237 aa  196  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1041  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.15 
 
 
238 aa  194  9e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1341  pyridoxine 5'-phosphate synthase  48.16 
 
 
246 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000107326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  42.8 
 
 
238 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.735952 
 
 
-
 
NC_004310  BR1385  pyridoxine 5'-phosphate synthase  47.76 
 
 
246 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0165798  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1810  pyridoxine 5'-phosphate synthase  46.94 
 
 
245 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0918  pyridoxine 5'-phosphate synthase  44.08 
 
 
244 aa  189  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3259  Pyridoxine 5'-phosphate synthase  50.42 
 
 
255 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0247328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0377  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.67 
 
 
255 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0844615  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0320  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.73 
 
 
244 aa  143  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0336  pyridoxine 5'-phosphate synthase  38.21 
 
 
264 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305659  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0370  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.18 
 
 
264 aa  138  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.225374  normal  0.0276101 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3458  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.02 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479661  normal  0.67158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0997  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.89 
 
 
247 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1678  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
240 aa  132  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0488  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
251 aa  132  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4214  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  36.63 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3948  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.21 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13830  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.85 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1076  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.98 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2781  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
243 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2956  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
243 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.586125  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2844  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
243 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.776191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2821  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
243 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2740  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
243 aa  128  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2629  pyridoxine 5'-phosphate synthase  36.99 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1385  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  32.93 
 
 
250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1436  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.57 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.532201  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.6 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4285  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.29 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4371  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.16 
 
 
246 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.194442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2043  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.59 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1118  pyridoxine 5'-phosphate synthase  31.56 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0749349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2717  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
243 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4746  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 
248 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.314773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2929  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
243 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.513928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54290  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.2 
 
 
248 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02458  pyridoxal phosphate biosynthetic protein  32.52 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1104  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  32.52 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1113  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3800  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02422  hypothetical protein  32.52 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2850  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.445885  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2719  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1675  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.92 
 
 
243 aa  123  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0409  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.73 
 
 
248 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1124  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 
241 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.595561  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1403  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.01 
 
 
241 aa  122  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0667  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
236 aa  122  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.357932  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0867  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
240 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0203459 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1011  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.47 
 
 
240 aa  122  7e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0291061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3666  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
243 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2036  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.45 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0446  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.84 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86215  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1600  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.58 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1860  pyridoxine 5'-phosphate synthase  34.82 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1944  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  32.93 
 
 
255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.35633  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3051  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.52 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.397726  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0975  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
248 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0281  pyridoxine 5'-phosphate synthase  35.27 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32709 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12131  pyridoxine 5'-phosphate synthase  30.33 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1008  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.74 
 
 
248 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0252  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  34.01 
 
 
245 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1256  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.06 
 
 
241 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2782  pyridoxal phosphate biosynthetic protein PdxJ  32.93 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3614  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1192  pyridoxine 5'-phosphate synthase  32.93 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0484  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.88 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00217083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2634  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1478  pyridoxine 5'-phosphate synthase  33.61 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.323845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>