More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0792 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  537  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 272 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  74.15 
 
 		 274 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.32 
 
 		 246 aa  268  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1703  Crp/FNR family transcriptional regulator  58.92 
 
 		 276 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0806739  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  52.63 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 265 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  57.64 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.5 
 
 		 242 aa  248  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.07 
 
 		 262 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 251 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  49.6 
 
 		 260 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  52.19 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.04 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.78 
 
 		 232 aa  234  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 260 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.04 
 
 		 242 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  50.22 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 242 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 242 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.84 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.25 
 
 		 403 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 257 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1244  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 249 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 249 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4265  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 259 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367581  normal  0.892156 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.42 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 247 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 630 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  50 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1665  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00239618  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.68 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.64 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4238  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0460631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  218  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3764  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.98 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4433  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 224 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4272  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.89 
 
 		 218 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.71016  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.43 
 
 		 250 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  46.75 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  46.75 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  41.7 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2510  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.37 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.6173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.68 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.68 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.291712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.57 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.91 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.81 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3034  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0190  transcription regulator protein  39.68 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.73 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.29 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.36 
 
 		 250 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.97 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.97 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.97 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.97 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.97 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  39.39 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  40.37 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.97 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.93 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.93 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2471  CRP/FNR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185946  normal  0.661743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>