30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1025 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1025  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  988    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1057  alginate biosynthesis protein AlgX  61.14 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0893074  normal  0.4674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1237  alginate biosynthesis protein AlgX  61.36 
 
 		 479 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10910  alginate biosynthesis protein AlgX  61.61 
 
 		 483 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0954  alginate biosynthesis protein AlgX  58.59 
 
 		 483 aa  580  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0883  alginate biosynthesis protein AlgX  57.54 
 
 		 479 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.126273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4443  alginate biosynthesis protein AlgX  56.9 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0249363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1282  alginate biosynthesis protein AlgX  57.11 
 
 		 479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4567  alginate biosynthesis protein AlgX  56.69 
 
 		 479 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1599  alginate biosynthesis protein AlgX  53.03 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18480  alginate biosynthesis protein AlgX  53.15 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1669  hypothetical protein  32.14 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652134  normal  0.59786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4446  hypothetical protein  31.7 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0632572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1279  alginate O-acetylation protein AlgJ  31.92 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4570  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  32.41 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1022  hypothetical protein  31.73 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.843839 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1054  alginate biosynthesis protein AlgJ  32.1 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.690325  normal  0.470926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1234  alginate biosynthesis protein AlgJ  32.1 
 
 		 391 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736293  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18430  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.52 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.327755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1596  alginate o-acetyltransferase AlgJ  30.42 
 
 		 391 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1904  hypothetical protein  25.85 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000430551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0880  alginate O-acetylation protein AlgJ precursor  33.45 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0951  alginate biosynthesis protein AlgJ  31.41 
 
 		 390 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10880  Alginate biosynthesis protein AlgV  29.63 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1034  cell morphology protein  30.43 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1671  hypothetical protein  27.9 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0836481  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1903  putative alginate biosynthesis protein algJ  28.73 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  hitchhiker  0.000024622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1750  cell morphology protein  22.69 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2941  hypothetical protein  26.5 
 
 		 346 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.403245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1749  hypothetical protein  24.54 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0887417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>