More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0323 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0323  ParB-like partition protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0116739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2096  chromosome segregation DNA-binding protein  77.63 
 
 
296 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2055  parB-like partition protein  74.24 
 
 
298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2438  parB-like partition protein  72.95 
 
 
298 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  69.18 
 
 
292 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  68.47 
 
 
294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1804  ParB-like partition protein  66.78 
 
 
303 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.593981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  44.33 
 
 
307 aa  228  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2561  chromosome partitioning protein  45 
 
 
306 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0012978  normal  0.245215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  44.26 
 
 
296 aa  225  7e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  42.81 
 
 
286 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  44.82 
 
 
294 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  46.01 
 
 
305 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  41.3 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0242  parB-like partition protein  45.11 
 
 
304 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  46.18 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  45.7 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2030  parB-like partition protein  45.45 
 
 
311 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.503614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3424  parB-like partition protein  43 
 
 
285 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3138  partition protein ParB-like  44.41 
 
 
284 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  42.52 
 
 
282 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  41.3 
 
 
298 aa  210  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  39.52 
 
 
298 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0347  chromosome segregation DNA-binding protein  42.18 
 
 
299 aa  208  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3412  chromosome segregation DNA-binding protein  43.58 
 
 
279 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  42.67 
 
 
303 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  41.72 
 
 
310 aa  206  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  39.86 
 
 
298 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  39.52 
 
 
298 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0141  spoOJ protein  40.74 
 
 
289 aa  204  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.665328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  41.97 
 
 
302 aa  204  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5606  stage 0 sporulation protein J  37.88 
 
 
283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.50133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5329  stage 0 sporulation protein J  37.88 
 
 
283 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.469173  hitchhiker  0.000039914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5630  stage 0 sporulation protein J  36.95 
 
 
283 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0501  parB-like partition protein  41.64 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5666  stage 0 sporulation protein J  37.2 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  44.14 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5176  stage 0 sporulation protein J  37.2 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  42.52 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.16 
 
 
289 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5589  stage 0 sporulation protein J  36.86 
 
 
283 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000816094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4257  parB-like partition protein  41.22 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000997018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5332  stage 0 sporulation protein J  36.86 
 
 
283 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  42.52 
 
 
295 aa  198  9e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  42.07 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5272  parB-like partition protein  37.2 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  44.4 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.01 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  38.57 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  39.12 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.72 
 
 
279 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5160  stage 0 sporulation protein J  39.13 
 
 
256 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  41.67 
 
 
290 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  41.67 
 
 
290 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.01 
 
 
290 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2987  stage 0 sporulation protein J  39.53 
 
 
286 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.157313  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2665  stage 0 sporulation protein J  39.53 
 
 
286 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5729  stage 0 sporulation protein J  39.13 
 
 
256 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3320  parB-like partition protein  40.96 
 
 
302 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0606  ParB family protein  39.25 
 
 
297 aa  192  7e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  38.91 
 
 
312 aa  192  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  38.57 
 
 
285 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  39.66 
 
 
289 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  40.28 
 
 
289 aa  189  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  48.9 
 
 
287 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  37.58 
 
 
288 aa  188  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0107  ParB-like nuclease domain-containing protein  43.14 
 
 
269 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0107  chromosome segregation DNA-binding protein  37.95 
 
 
294 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00389031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  42.21 
 
 
290 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  39.46 
 
 
321 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  42.11 
 
 
289 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  37.59 
 
 
280 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  39.02 
 
 
284 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  41.03 
 
 
290 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  41.03 
 
 
288 aa  186  6e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  40.73 
 
 
306 aa  185  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0008  parB-like partition protein  37.67 
 
 
281 aa  185  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  40.62 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  40.13 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  41.87 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  41.32 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  42.95 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  40.97 
 
 
290 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  41.16 
 
 
272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2925  parB-like partition protein  40.96 
 
 
283 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40.41 
 
 
274 aa  182  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1741  Spo0J-like protein  38.49 
 
 
293 aa  182  7e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00987  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  39.31 
 
 
280 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  36.93 
 
 
314 aa  181  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.32 
 
 
323 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  40.28 
 
 
286 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0133  parB-like partition protein  38.85 
 
 
294 aa  180  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265862  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  38.91 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39730  chromosome segregation DNA-binding protein  38.05 
 
 
328 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  35.86 
 
 
283 aa  178  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  38.54 
 
 
358 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0408  parB-like partition protein  38.85 
 
 
278 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0649712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  38.85 
 
 
278 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  37.46 
 
 
283 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  40.54 
 
 
282 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>