40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0173 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0173  hypothetical protein  100 
 
 
793 aa  1553    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.198543  normal  0.42637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2437  hypothetical protein  53.02 
 
 
788 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0260  hypothetical protein  55.26 
 
 
818 aa  803    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2072  hypothetical protein  49.48 
 
 
784 aa  639    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404123  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2303  hypothetical protein  48.02 
 
 
786 aa  660    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505453 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1857  hypothetical protein  49.94 
 
 
798 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2277  hypothetical protein  51.35 
 
 
886 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2877  hypothetical protein  26.09 
 
 
819 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2744  hypothetical protein  25.9 
 
 
805 aa  144  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.923745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0636  hypothetical protein  26.01 
 
 
800 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.69308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4104  hypothetical protein  23.62 
 
 
839 aa  137  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1418  hypothetical protein  25.87 
 
 
810 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08841  hypothetical protein  22.76 
 
 
809 aa  134  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.25217  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3101  conserved hypothetical protein, membrane  24.35 
 
 
830 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000415978  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2176  hypothetical protein  23.15 
 
 
728 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5804  hypothetical protein  22.9 
 
 
840 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.415514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3849  hypothetical protein  26.55 
 
 
815 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2022  hypothetical protein  22.73 
 
 
847 aa  122  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0457353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1795  hypothetical protein  22.22 
 
 
795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0545574  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4033  hypothetical protein  22.32 
 
 
825 aa  119  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411624  normal  0.743107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3354  hypothetical protein  26.29 
 
 
726 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2424  hypothetical protein  22.08 
 
 
812 aa  114  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.401165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0571  hypothetical protein  30.55 
 
 
836 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.097653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4060  hypothetical protein  25.89 
 
 
822 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2771  hypothetical protein  23.16 
 
 
801 aa  110  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.181067  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2385  hypothetical protein  22.01 
 
 
901 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3503  hypothetical protein  27.92 
 
 
819 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15934e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3438  hypothetical protein  27.07 
 
 
821 aa  98.6  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00306475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3775  hypothetical protein  28.92 
 
 
809 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2691  hypothetical protein  25.07 
 
 
856 aa  80.5  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000753337  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0232  hypothetical protein  27.31 
 
 
825 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0449  hypothetical protein  28.57 
 
 
823 aa  64.7  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.792985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7207  hypothetical protein  28.38 
 
 
801 aa  64.3  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.716756  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6293  hypothetical protein  27.07 
 
 
801 aa  61.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00473793  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1843  hypothetical protein  24.85 
 
 
870 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.882211  normal  0.181508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1817  hypothetical protein  27.86 
 
 
821 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41308  normal  0.676829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7627  hypothetical protein  29.87 
 
 
1045 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540732  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2073  hypothetical protein  24.47 
 
 
1047 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0394  hypothetical protein  25 
 
 
744 aa  48.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.336703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2298  hypothetical protein  25.94 
 
 
869 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.23448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>