More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3862 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  100 
 
 
443 aa  910    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.52 
 
 
421 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.72 
 
 
443 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.27 
 
 
434 aa  422  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  51.09 
 
 
427 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.35 
 
 
438 aa  419  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.48 
 
 
447 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.84 
 
 
439 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  49.66 
 
 
449 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.32 
 
 
448 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.28 
 
 
433 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.53 
 
 
441 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.46 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  47.67 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.89 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.89 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.89 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.02 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.26 
 
 
706 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  47.14 
 
 
424 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.33 
 
 
441 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.99 
 
 
444 aa  398  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.84 
 
 
422 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.94 
 
 
451 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  47.03 
 
 
445 aa  394  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.33 
 
 
434 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.38 
 
 
442 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.11 
 
 
443 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.3 
 
 
425 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.62 
 
 
438 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.54 
 
 
425 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.68 
 
 
431 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.62 
 
 
438 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.34 
 
 
425 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.58 
 
 
429 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2518  NADH dehydrogenase I subunit F  45.22 
 
 
431 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1180  NADH dehydrogenase I subunit F  45.22 
 
 
431 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258408  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.52 
 
 
426 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
444 aa  386  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  45.41 
 
 
428 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0486  NADH dehydrogenase I subunit F  46.28 
 
 
427 aa  383  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  45.54 
 
 
432 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2160  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.66 
 
 
443 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.54 
 
 
429 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.16 
 
 
438 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.15 
 
 
427 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46 
 
 
443 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.09 
 
 
445 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  45.25 
 
 
438 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  46.37 
 
 
422 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0748  NADH dehydrogenase I subunit F  49.24 
 
 
432 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147388  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.11 
 
 
426 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.15 
 
 
427 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  44.11 
 
 
545 aa  383  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.15 
 
 
456 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  46.37 
 
 
422 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1316  NADH dehydrogenase I subunit F  45.92 
 
 
433 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132795  normal  0.0201547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.8 
 
 
440 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.49 
 
 
438 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0720  NADH dehydrogenase (quinone)  44.11 
 
 
545 aa  381  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00999729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.82 
 
 
439 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.95 
 
 
426 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1179  NADH dehydrogenase I subunit F  45.2 
 
 
431 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.049393  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.4 
 
 
446 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2001  NADH dehydrogenase I subunit F  45.71 
 
 
431 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.675506  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.38 
 
 
441 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1357  NADH dehydrogenase I subunit F  46.59 
 
 
434 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.825639  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1718  NADH dehydrogenase I subunit F  46.35 
 
 
434 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  45.75 
 
 
428 aa  376  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1265  NADH dehydrogenase I subunit F  46.35 
 
 
434 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.78 
 
 
444 aa  378  1e-103  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  46.8 
 
 
448 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2243  NADH dehydrogenase I subunit F  47.21 
 
 
431 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0486512  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  49.74 
 
 
429 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  46.76 
 
 
445 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.87 
 
 
454 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0481  NADH dehydrogenase (quinone)  44.62 
 
 
452 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  45.77 
 
 
436 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  45.82 
 
 
426 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1612  NADH dehydrogenase (quinone)  45.52 
 
 
466 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.709157  normal  0.640028 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0548  NADH dehydrogenase I subunit F  45.65 
 
 
427 aa  374  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43184  predicted protein  46.35 
 
 
449 aa  372  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.236516  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3333  NADH dehydrogenase I subunit F  44.63 
 
 
441 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.240845  normal  0.194232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  43.69 
 
 
454 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 
427 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 
427 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  45.05 
 
 
427 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.52 
 
 
445 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0976  NADH dehydrogenase I subunit F  48.63 
 
 
417 aa  371  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  46.56 
 
 
461 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>