More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2864 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 212 aa  414  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  57.07 
 
 		 197 aa  214  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.02 
 
 		 197 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.02 
 
 		 197 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.02 
 
 		 197 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.02 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  56.02 
 
 		 197 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  56.02 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.64 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  55.5 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  55.5 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.05 
 
 		 198 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.08 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.15 
 
 		 198 aa  208  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  55.56 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  53.61 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2133  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59.28 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.382679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2224  hypothetical protein  59.28 
 
 		 198 aa  206  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  53.54 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  56.02 
 
 		 200 aa  204  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  56.08 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  55.26 
 
 		 197 aa  198  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.45 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  53.4 
 
 		 197 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01317  multiple antibiotic resistance protein MarC  56.57 
 
 		 199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.355681  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  51.31 
 
 		 194 aa  193  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  54.74 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  53.4 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.11 
 
 		 197 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  56.02 
 
 		 197 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  53.68 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  51.81 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.11 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  53.16 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  51.61 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  51.31 
 
 		 194 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.64 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  47.59 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.39 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.91 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.39 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  47.64 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  47.64 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  47.64 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.39 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  47.64 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  47.64 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  47.64 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.39 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.39 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  47.64 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.07 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  46.6 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.39 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  46.84 
 
 		 203 aa  167  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  47.12 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  50 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  40.53 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  44.44 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  44.44 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0447  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.16 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.55 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72410  hypothetical protein  45.03 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.65 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6285  hypothetical protein  44.5 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.85 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.62 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.13 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.85 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.302535  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1167  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.23 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1018  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.49 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1724  MarC family integral membrane protein  37.63 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.16 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  33.16 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.96 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  27.59 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.49 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.02 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  30.54 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.64 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  26.87 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  28.21 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.77 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  31 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.74 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.14 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0517184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  30.3 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.19 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.37 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  27.5 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>