More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_3266 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  100 
 
 
200 aa  387  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  98.5 
 
 
200 aa  380  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  91 
 
 
200 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  91.5 
 
 
200 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  91 
 
 
200 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  91 
 
 
202 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  90.5 
 
 
200 aa  359  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  91 
 
 
200 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  90 
 
 
200 aa  357  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  84 
 
 
201 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  82 
 
 
199 aa  315  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  81 
 
 
199 aa  308  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  71 
 
 
197 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  71 
 
 
197 aa  267  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  71.5 
 
 
197 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0447  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  65.52 
 
 
200 aa  234  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  64 
 
 
200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  49.49 
 
 
200 aa  191  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1167  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.02 
 
 
200 aa  165  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.13 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.88 
 
 
197 aa  161  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.64 
 
 
200 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.16 
 
 
201 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.9 
 
 
218 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.39 
 
 
198 aa  158  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.64 
 
 
212 aa  158  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.88 
 
 
197 aa  158  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  46.43 
 
 
197 aa  157  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.79 
 
 
196 aa  157  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.85 
 
 
196 aa  157  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.33 
 
 
198 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  44.1 
 
 
197 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  44.1 
 
 
197 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.84 
 
 
200 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.62 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.62 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.1 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.62 
 
 
197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.62 
 
 
197 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.1 
 
 
197 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  45.92 
 
 
197 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.59 
 
 
197 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.59 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  41.75 
 
 
194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  42.86 
 
 
197 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2224  hypothetical protein  46.37 
 
 
198 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2133  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.37 
 
 
198 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.382679  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.88 
 
 
197 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.88 
 
 
197 aa  149  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01317  multiple antibiotic resistance protein MarC  46.63 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.355681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  44.16 
 
 
197 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.08 
 
 
197 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.08 
 
 
197 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.75 
 
 
194 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.24 
 
 
197 aa  141  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  42.27 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.37 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.2 
 
 
203 aa  136  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.5 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  40.1 
 
 
197 aa  131  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  40.1 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72410  hypothetical protein  41.54 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6285  hypothetical protein  41.54 
 
 
197 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1018  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.39 
 
 
201 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.71 
 
 
199 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  38.34 
 
 
205 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1724  MarC family integral membrane protein  45.5 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.24 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  41.45 
 
 
222 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.302535  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  30.85 
 
 
204 aa  104  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.92 
 
 
207 aa  98.2  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  32.67 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  34.95 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.95 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  30.73 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.82 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  32.18 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  32.49 
 
 
217 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  28.08 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.88 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.14 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.67 
 
 
208 aa  89  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3071  MCP methyltransferase, CheR-type  30 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.574672  normal  0.0243793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.5 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  29.19 
 
 
203 aa  87  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.93 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>