More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0614 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0447  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  73.37 
 
 		 200 aa  268  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.5 
 
 		 197 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  66.5 
 
 		 197 aa  257  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  68.34 
 
 		 201 aa  255  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  67.01 
 
 		 197 aa  251  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  65.83 
 
 		 199 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  64.32 
 
 		 199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  64 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  62.5 
 
 		 200 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  62.5 
 
 		 200 aa  237  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.88 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  63 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  63.5 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  62 
 
 		 200 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  63.5 
 
 		 200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  64 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  64 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  64 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  64 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  64 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  64 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  64 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  51.28 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.32 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1167  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.87 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.68 
 
 		 218 aa  167  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  46.28 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.1 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.33 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.62 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.78 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  45.21 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.68 
 
 		 196 aa  164  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.68 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.68 
 
 		 197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.68 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.68 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.83 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.21 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.68 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  44.44 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.68 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.59 
 
 		 212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  44.97 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.15 
 
 		 197 aa  160  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.15 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  48.15 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  48.15 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  46.56 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  48.15 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  46.03 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  43.16 
 
 		 194 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.92 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.92 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  43.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  42.71 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  46.56 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  42.71 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  40.1 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  44.21 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  39.2 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2224  hypothetical protein  44.5 
 
 		 198 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2133  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.5 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.382679  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01317  multiple antibiotic resistance protein MarC  44.5 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.355681  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.96 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.01 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.14 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1018  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36.22 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  37.91 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72410  hypothetical protein  42.93 
 
 		 197 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.79 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6285  hypothetical protein  42.39 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.37 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.302535  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  30.93 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.03 
 
 		 209 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2825  integral membrane protein, MarC family  31.79 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1724  MarC family integral membrane protein  39.79 
 
 		 194 aa  97.8  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0241  hypothetical protein  29.03 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.425309  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.54 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  26.11 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3347  multiple drug resistance protein MarC  30.1 
 
 		 217 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.41 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.41 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00158  multiple antibiotic transporter  32.46 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.49 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2385  hypothetical protein  31.98 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0520514  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0374  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.18 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.774303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.5 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.81 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1929  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.82 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  30.35 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.93 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>