More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3746 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3746  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000432224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  92.82 
 
 		 201 aa  359  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000587545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4828  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  91.28 
 
 		 200 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0129  hypothetical protein  90.31 
 
 		 197 aa  353  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4152  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  89.34 
 
 		 198 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  90.36 
 
 		 197 aa  351  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0487313  hitchhiker  0.00000474402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0118  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  89.85 
 
 		 197 aa  351  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000568388  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  89.85 
 
 		 199 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00811054  hitchhiker  0.000115655 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0124  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  90.67 
 
 		 197 aa  348  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0309852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4231  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  88.83 
 
 		 197 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0127  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  88.83 
 
 		 197 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  88.83 
 
 		 197 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0123  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  88.32 
 
 		 197 aa  347  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0092  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  87.31 
 
 		 197 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3626  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  86.73 
 
 		 198 aa  339  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.416857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0045  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  87.56 
 
 		 218 aa  338  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3941  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  69.27 
 
 		 196 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00858561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  65.99 
 
 		 200 aa  268  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00283  antibiotic transporter  63.92 
 
 		 194 aa  257  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.25 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.25 
 
 		 197 aa  248  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002135  multiple antibiotic resistance protein marC  65.98 
 
 		 194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.18 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.21 
 
 		 197 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.69 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0268  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.73 
 
 		 197 aa  237  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4111  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.95 
 
 		 197 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.779903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0140  putative dITP- and XTP- hydrolase  64.95 
 
 		 197 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0218  putative dITP- and XTP- hydrolase  62.69 
 
 		 197 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4015  putative dITP- and XTP- hydrolase  65.97 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4649  putative dITP- and XTP- hydrolase  63.73 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.04 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01317  multiple antibiotic resistance protein MarC  55.21 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.355681  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2864  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.64 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2133  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.4 
 
 		 198 aa  193  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.382679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2224  hypothetical protein  54.4 
 
 		 198 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.17 
 
 		 197 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  48.69 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  48.17 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  45.83 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.97 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.83 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0164  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.96 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.08 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  45.08 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.56 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.68 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  45.08 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.04 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.04 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  45.08 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.04 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.56 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  43.88 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  43.88 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  43.88 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  43.88 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  43.88 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  43.88 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  43.88 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  43.37 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.52 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2020  hypothetical protein  42.33 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2198  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.56 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.617868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72410  hypothetical protein  49.21 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.140736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6285  hypothetical protein  49.73 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0182  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.36 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000388483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0447  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  43.46 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2070  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  42.64 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  43.3 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1018  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.92 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1717  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  42.05 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.302535  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0128  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.45 
 
 		 205 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1167  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  41.81 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  36.92 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0906  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.75 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201578  normal  0.0510602 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0161  hypothetical protein  32.65 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.68 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.33 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1724  MarC family integral membrane protein  33.85 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  35.38 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  35.38 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.29 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0644  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.69 
 
 		 204 aa  93.6  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  27.72 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.32 
 
 		 219 aa  91.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.08 
 
 		 202 aa  91.3  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000046015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1840  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  27.08 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000421483  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0451  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.23 
 
 		 219 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.01 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_002620  TC0241  hypothetical protein  27.6 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.425309  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.74 
 
 		 212 aa  88.6  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32 
 
 		 224 aa  88.2  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174302  normal  0.860871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>